RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00057

RNA: SRP_00057
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((..(((((((((.((.((.(((.(..(((((....(((((....(((....)))....))))).)))))...).))))...).))....))))))))).))))).....
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((......((((.(..(((((....(((....)))....))))))))))........)))))).))....))))))))))))))).....
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................................................(((....))).......................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)).)))))....)))))..............
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................(((((((((((....)))))))))))...............................................
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.(((((((((....(((((....(((((....(((....).))...))))).))))).....).)))))).))....))))))))))))))).....
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((.(((((((((....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).....)).))))).))....))))))))))..........
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..((((((((((.(..(((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......)))))...)....)))))))))).)))).....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.(((((((((...((((((....(((((..(.(((....).)).).))))).)))))....)).)))))).))....))))))))))))))).....
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((((((.......((((...............[[[[[[(((....))).))))....(((....)))........]]]]]]..))))))))))..........
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................((((....(((....)))....))))...............................................
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((...((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......)))))).......))))))))))))))).....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((.....(((((....(((((....(((.....)))...))))).))))).......)))))).))....))))))))))))))).....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((....(((..(....(((((....(((....)))....))))).....)..)))..)))))).))....))))))))))))))).....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......)))))).))....))))))))))))))).....
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((((((((((((...(((((((((((((((((((((((..).))))))))))))))))))))))))).)))).))...)))))))))))))))).....
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.((.......((((((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..))))).)).)))))...))))))........))....
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((..............................((((....(((....)))....)))).................................))............
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................((((....(((....)))....))))...............................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((((((((..((((((.....(((((....(((((....(((.....)))...))))).))))).......))))))..)....))))))))))))))).....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((...((((((.....(((((....(((((..................))))).))))).......)))))).......))))))))))))))).....
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........(((((((....(((((.......................................................)))))........))))))).............
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................((((....(((....)))....))))...............................................
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))........................
PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................((((....(((....)))....))))...............................................
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))........................
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................((((....(((....)))....))))...............................................
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................(((.....(((....))).....)))...............................................
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......)))))).))....))))))))))))))).....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((((((((.((((((((....(((((.(..(((((....(((.....)))...))))))))))).....).)))))).))....))))))))))))))).....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((...((((((.....(((((....(((((..................))))).))))).......)))))).......))))))))))))))).....
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................((((....(((....)))....))))...............................................
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))..........................................
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................((((....(((....)))....))))...............................................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......)))))).))....))))))))))))))).....
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......)))))).))....))))))))))))))).....
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((.....(((((....(((((....(((....)))....))))).))))).......)))))).))....))))))))))))))).....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((((((...(..(((..))))....))))((((((((......))..(((((.((((..)))).).))))))))))...)))))))))))))))(..).
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(............................(..((......((((.....((.....))....))))....................)......)....).........)....
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................................................................(.......)....................
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((....(((..(....(((((....(((....)))....))))).....)..)))..)))))).))....))))))))))))))).....
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((((((((..((((((.....((((.....(((((....(((.....)))...)))))..)))).......))))))..)....))))))))))))))).....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((.((((((((....(((..(....(((((....(((....)))....))))).....)..)))..)))))).))....))))))))))))))).....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((((.((..........))))).((((........))))....))).(((.(((.((...............)))))((((..........))))...)))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((....((((.((.[[[......)))))).(((.....]]]))).))))...((((.(((.((...............)))))((((..........))))...))))...

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