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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00060



RNA: SRP_00060
Rfam family: Metazoa_SRP

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((....(((((...(((((((....(((((((((....((((((..((((.((...(((((.(((..(((((((((.(((...(((((((....))).))))..((((((.((((((((........))))...)))).))))))...)))....(((....)))...)))))))))...))))))))..)).))))...))))))..)))))))))))))))).....)))))...))))))))...
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DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((..........)))).........(((.......)))...(((.......(((((((.(((((((....(((((((((.(((.((((((......(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((....))))))).))))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).))))))).)..)))))))...)))))))...)))))))))))))))))))))))))..)).)))))......))).....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((......)))))))....(((((....)))))....((((((((....(((((...(((((((....(((((((((((((((....)))))))((((((((((.((((.(((((((((((((.(((....((((((....))))))....))).))))..........((((....(((....(((....)))....)))......)))))))))))))..)))))))...))))))).((((....))))))))))))))))))).....)))))...))))))))...
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((....(((((((.(((((((....(((((((((..(.(((((((....((.(((((((((.((((.(((((((((((((.((((((.((((((....)))))).)))))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...))))))))..)))))))).))))))))))))))))..)).)))))...))))))))...
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MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((......))))))).....((........)).)))..(((((((.(..(((((((.(((((((....(((((((((.(((.((((((.((..((((((((((.(((((.(((((((((.(((.(((((((((((((....))))))))))))).)))......((((...(....((((....(((....)))....))))...))))).)))))))))..))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))..)).)))))..))))))))....
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((....(((((((.(((((((....(((((((((..(.(((((((....(.((((((((((.((((.(((((((((((((.((((((.((((((....)))))).)))))).)))).........((((.....(((....(((....)))....)))....))))..)))))))))..))))))))...)))))))..)))))))).))))))))))))))))..)).)))))...))))))))...
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((....(((((...(((((((....(((((((((....(((((((((((.......(((((.((((...(((((..((((.((((((.((((((....)))))).)))))).))))................(((((...)))))....)))))..........((((....))))...)))))))))..)))).....)))))))..)))))))))))))))).....)))))...))))))))...
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((.(..(((((...(((((((....(((((((((..(.(((((((..((..((((((((((.((((.(((((((((((((.(((..(.((((((....)))))).)..))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...))))))))).)))))))).)))))))))))))))).....)))))..)))))))))...
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((.(((((......)))))......(((.(((.......))).))).....))).(((..((((((..((((..(((((((((....(((((((..((..((((((((((.((((.(((((((((((((.((((((.((((((....)))))).)))))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...))))))))).)))))))..)))))))))...))))....))))))..))).........
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((......)))))))....(((((....)))))))).((((((((.(..(((((...(((((((....(((((((((((((((....)))))))((((((((((.((((.(((((((((((((.(((..(.((((((....)))))).)..))).))))......((((.(....).)))).(((((....)))....(((....))).)))))))))))..)))))))...))))))).((((....))))))))))))))))))).....)))))..)))))))))...
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.(((((((((..)..)))))))).)...(.(((((..)).))))((((((..(((.(.....(((((((((((..(((((((((.((.(((((((..(.(.((((((((((.((((..((((((((((((((..(...(((..)))...)))))))...(((........))).(((((...(.(((((((((((..))))))))))))...))))).))))))))...))))))))...)))))).))))))))))))))))))))...))))))..)))))..))))))))))...
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((.(..(((((((.(((((((....(((((((((..(.(((((((......((((((((((.((((.(((((((((((((.(((..(.((((((....)))))).)..))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...))))))...)))))))).))))))))))))))))..)).)))))..)))))))))...
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((....(((((...(((((((....(((((((((..(.(((((((..((..((((((((((.((((.(((((((((((((.(((..(.((((((....)))))).)..))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...))))))))).)))))))).)))))))))))))))).....)))))...))))))))...
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((......))))))))...(((((....)))))....((((((((.............((((....))))...((((((((((....)))))))..(((((.........))))).....))).(((((..((((((....))))))..)))))..((((((.....)).)))).((((.....)))).........((((......((((....)))).(((.((......))))).((((((....)))))).....)))).(((((.....))))).))))))))...
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...aaa))))))...(((.......)))..)))).((((((((.............((((....))))..(((((((((((....)))))))...((((.{{{.....)))).}}}.AAA...((((..((((((....)))))).....((((..((((....<<<<)))).((((.....)))).......[[[[[[......((((....))))......))))..(((]]]]]]..)))..>>>>.))))...)))).(((((.....))))).))))))))...