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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00069



RNA: SRP_00069
Rfam family: Fungi_SRP

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CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................((.((...((((((....................((((....)))).......(((.(((((((..(((((((((......(((...(((((.((....)))))))....)))............((((((((...((((....(((....)))....)))))))))))))))))).)))...)).)))))....))).............................))))))....))))......
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((.....)))...(((((......))))).....(((((((((((((((((.........(((((((((((((((.(((.(((((((((...(((((.((((((((.((....)))))))..)))))))).(((.((((...)))).)))........((......))..(........)....)))))).)))..)))..)))))...))))))))))..)))))))))))).)))))..((.(......).))......
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((.....(((((......))))).....((((((((((((((((((........((((((((((((........(((((...........((((((((((.........)))))..)))))...((((.((((...)))).))))....)))))........((((......))))........((((......))))...)))))))))))).))))))))))))).)))))....)))))))...........
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.((((((......(((((......))))).....((((((((((((((((((........(((((((((((((((.(((.((((..(((...((((((.(((((((.((....)))))))..))))))))..........((((((....((((....(((....)))....)))).)))))).)))..).)))..)))..))))...))))))))))).))))))))))))).))))).....)))))).))........
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.((((((.((...(((((......)))))...))((((((((((((((((((........(((((((((((((((.(((.((((..(((...(((.((((((((((.((....)))))))..))))))))..........((((((....((((....(((....)))....)))).)))))).)))..).)))..)))..))))))...))))))))).))))))))))))).))))).....)))))).))........
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RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...))))).................................................................................(.......................(.....................)............(((((.........)))))......................................................................................)....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((......(((((......))))).....((((((((((((((((((........(((((((((((((((.(((.((((..(((...(((((.((((((((.((....)))))))..))))))))..........((((((....((((....(((....)))....)))).)))))).)))..).)))..)))..)))))...)))))))))).))))))))))))).))))).....))))))...........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))..((((((..((((((.....))))))))))))................(((((((((((((((.(((.((((..(((...((((((.(((((((.((....)))))))..))))))))..........((((((....((((....(((....)))....)))).)))))).)))..).)))..)))..))))...)))))))))))...(((((((((..(........)..)))....))))))...
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..........))))....((((((.....))))))..((((..((((((....))).((((...<<<....))))..[[[[.)))......((((((..]]]))))))...((({{{{........)))...(((.....))).(((((.(((}}}}.....))).(((]>>>..))).....)))))bbb))))..BBB.(((.(((...aaa.)))...((((((..AAA.))))))..)))..............