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GGAGAUCGGCGCGGACGGAGUCCUCGCCAACCUGGUCAGGGCCGAGAGGCAGCAGCCACAACGAGAUCACCUCUGGGUCGUCUGCCGGUCUCCACCUCAUUUUCCUCGAAAUU |
Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
(((((((((.((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))...)))))))))....................
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Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.....((((.((((...)))).)))).....(((..(((((....((((((.(((.((..(((.....)))))))).).))))))))))..)))...............)) |
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))....................................................... |
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..)))))))))).....(((((....))))). |
Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............................................(((((.............................)))))........................... |
CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((.((((((..(((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))))).....))))))).............)))))........ |
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................(((((((((((....)))))))))))....................................................... |
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((.(((((.(((.....))).)))))..((((((....)..............)))))...)))))))))))))))).................... |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((..(((....((((......((((....(((....)))....))))...)))).......)))...)))...))))))))).................... |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..)))))))))).................... |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).)))))(.((((((....)..............))))).).)))))))))))))))).................... |
Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((((...))))......((((((.....(((....)))...........[[[[.......))))))....)))))))))))...........]]]]..... |
DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))....................................................... |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((...(((.((((...)))).)))(((....))).....(((....(((.....)))))).)))))))))))))))).................... |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).))))).....(((....))).....(((.....)))....)))))))))))))))).................... |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..)))))))))).................... |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((((..(((((.(((.....))).))))).....(((....))).....................))))))))))))))).................... |
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))....(((((((((..))))))))))))))))))).......((((...)))).. |
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..(....((((..(((((((((.(.....((((....(((....)))....))))...)))))...))).....)).....))..)..........)..))))....... |
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))....................................................... |
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................................. |
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))....................................................... |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).))))).....(((....))).....(((.....)))....)))))))))))))))).................... |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..(((((((.....((((....((((..))))..)))).(((....)))....[[[[...((((..)))))))))))))))))))...........]]]]..... |
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............................(((((........(((((....................))))).........)))))......................... |
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))....................................................... |
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.......(((((..(((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))....)))))).....))))))........................... |
PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))....................................................... |
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((..(((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))....)))))).....))))))........................... |
PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
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................................((((....(((....)))....))))....................................................... |
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................(((.....(((....))).....)))....................................................... |
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..)))))))))).................... |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).))))).....(((....))).....(((.....)))....)))))))))))))))).....(.((((...))))). |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((..((((.((((...)))).))))...(((((...((((.(((((....................))))).))))....)))))............)))))........ |
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).................................................. |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))....................................................... |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..)))))))))).................... |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((..(((((.(((((..((.....))..))))).....(((....))).....(((.....)))....)))))))))))))))).................... |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((((...)))).))))..(.((((....)))).).((((((.(((.((..(((.....)))))))).).)))))))))))).................... |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..((((((.....((((.(.(.(.(((((((((((..)))))))))))).))))))...(((...))).)))))))))))))))..(.(.(........))).. |
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............................(....(.((....(........(....(.(...).)....).........)..)))...........)................ |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....................................................................................(((.................)))..... |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).)))))...................................)))))))))))))))).................... |
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((..((((..((.....))..))))....((((....)))).((((....................)))).((((((.....)))..))).......)))))........ |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((..((((.(((.....))).)))).....(((....))).(((((.............[[[[[[.))))).((.........]]]]]]..))....)))))........ |