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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00072



RNA: SRP_00072
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((.((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))...)))))))))....................
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.....((((.((((...)))).)))).....(((..(((((....((((((.(((.((..(((.....)))))))).).))))))))))..)))...............))
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................((((....(((....)))....)))).......................................................
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..)))))))))).....(((((....))))).
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CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((..(((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))))).....))))))).............)))))........
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................(((((((((((....))))))))))).......................................................
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((.(((((.(((.....))).)))))..((((((....)..............)))))...))))))))))))))))....................
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((..(((....((((......((((....(((....)))....))))...)))).......)))...)))...)))))))))....................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..))))))))))....................
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).)))))(.((((((....)..............))))).).))))))))))))))))....................
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.((((...))))......((((((.....(((....)))...........[[[[.......))))))....)))))))))))...........]]]].....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................((((....(((....)))....)))).......................................................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((...(((.((((...)))).)))(((....))).....(((....(((.....)))))).))))))))))))))))....................
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).))))).....(((....))).....(((.....)))....))))))))))))))))....................
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..))))))))))....................
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..(((((..(((((.(((.....))).))))).....(((....))).....................)))))))))))))))....................
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))....(((((((((..))))))))))))))))))).......((((...))))..
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..(....((((..(((((((((.(.....((((....(((....)))....))))...)))))...))).....)).....))..)..........)..)))).......
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................((((....(((....)))....)))).......................................................
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .................................................................................................................
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................((((....(((....)))....)))).......................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).))))).....(((....))).....(((.....)))....))))))))))))))))....................
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((((((.....((((....((((..))))..)))).(((....)))....[[[[...((((..)))))))))))))))))))...........]]]].....
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PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................((((....(((....)))....)))).......................................................
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).))))).....(((....))).....(((.....)))....)))))))))))))))).....(.((((...))))).
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((.((((...)))).))))...(((((...((((.(((((....................))))).))))....)))))............)))))........
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((((.....((((.(.(.(.(((((((((((..)))))))))))).))))))...(((...))).)))))))))))))))..(.(.(........)))..
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .............................(....(.((....(........(....(.(...).)....).........)..)))...........)................
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................................................................................(((.................))).....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((.(((((.((((...)))).)))))...................................))))))))))))))))....................
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((...(((((((..(.........((((....(((....)))....))))......).....))).....)))).))))))))))....................
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.(((((..((((......((((....(((....)))....))))...)))).....)))))..))))..))))))))))....................
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((..((.....))..))))....((((....)))).((((....................)))).((((((.....)))..))).......)))))........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((..((((.(((.....))).)))).....(((....))).(((((.............[[[[[[.))))).((.........]]]]]]..))....)))))........