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GUAAGUUGGGGACCUUUUAAGAGAAGAGACCUACGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGAAGUGUUUUCUUUUGCUAGAAGUGUUCUCCAACUUACUCUUCUUUU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
(..(((.((....(((((.(((((.(((..((.(.....((((....(((....)))....))))...).))...))).))))..))))))..........)).)))..).....
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Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).))))))..........)) |
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CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.((((((..((((((((..........((((....(((....)))....))))..........))))))))..))))))...))))))))))))......... |
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Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((..((((((.(((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))))).)))))....)))))................ |
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CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((((.(((((.(((((((.(.....((((....(((....)))....))))...).)).))))).))))..))))))...))))))))))))......... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((.((((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))...........)))))).))))))).).))))))))))))......... |
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DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((((((((((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))........))))))))...))))))...))))))))))))......... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).).))))))))))))......... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((...((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))...........)))))...)))))).)).)))))))))))......... |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((..))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).).))))))))))))......... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.....................................((((....(((....)))....)))).......................................).......... |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..(((((((((((.......))))).((.(((........))).))............))))))..)))))).)).)))))))))))......... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((........(((((.......))))).....)))))))((((((....((((((...)))))))))))).......))))))))))))......... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........(((((((.........(((((.......)))))......))))))).......................................................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............(((((.(((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))))).)))).......................... |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............(((((.(((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))))).)))).......................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................(((.....(((....))).....))).................................................. |
|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..(((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))...........))))))..)))))).)).)))))))))))......... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.((((((..((((((((..........((((..................))))..........))))))))..))))))...))))))))))))......... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))............................................ |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..))))))...))))))))))))......... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..(((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))...........))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((......)...(((((.......))))).((.(((.((...)))))))(((((((((....))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.................................(.(..(.(........(.............(...).............)..........))........).)....).... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................................................................(........(...............).....) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..(((((.((((.........))))..................................)))))..)))))).)).)))))))))))......... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..((((((((....(.....((((....(((....)))....))))......)...))))))))..)))))).)).)))))))))))......... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((......((((.....)))).(((((.......)))))..)))).((((.(((((.....(((((.....))))).))))).((((........))))...)))).... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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