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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00074



RNA: SRP_00074
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (..(((.((....(((((.(((((.(((..((.(.....((((....(((....)))....))))...).))...))).))))..))))))..........)).)))..).....
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (.(((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).))))))..........))
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................((((....(((....)))....))))..................................................
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.((((((..((((((((..........((((....(((....)))....))))..........))))))))..))))))...)))))))))))).........
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................((((.....................))))..........................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((..((((((.(((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))))).)))))....)))))................
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................(((((((((((....)))))))))))..................................................
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..(((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))...........))))))..)))))).).)))))))))))).........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(........................(.....((((....(((....)))....))))...)............................).................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((((.(((((.(((((((.(.....((((....(((....)))....))))...).)).))))).))))..))))))...)))))))))))).........
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((.((((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))...........)))))).))))))).).)))))))))))).........
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................((((....(((....)))....))))..................................................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((((((((((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))........))))))))...))))))...)))))))))))).........
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).).)))))))))))).........
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).))))))))).........
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MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((..))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))))).........
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...................................................................................................................
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................((((....(((....)))....))))..................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..(((((((((((.......))))).((.(((........))).))............))))))..)))))).)).))))))))))).........
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........(((((.......))))).....)))))))((((((....((((((...)))))))))))).......)))))))))))).........
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PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).))))))))).........
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((......)...(((((.......))))).((.(((.((...)))))))(((((((((....))))))..)))))).)))).))))))))).........
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.................................(.(..(.(........(.............(...).............)..........))........).)....)....
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...................................................................................(........(...............).....)
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..(((((.((((.........))))..................................)))))..)))))).)).))))))))))).........
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..((((((((....(.....((((....(((....)))....))))......)...))))))))..)))))).)).))))))))))).........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).))))))))).........
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((......((((.....)))).(((((.......)))))..)))).((((.(((((.....(((((.....))))).))))).((((........))))...))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((.((((.....)))).(((((.......))))).....((((....(((.((....{{{.))))).(((......)))[[[....}}})]]]...))))))...