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GUAAGUUGGGGACCUUUUAAGAGAAGAGACCUACGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGAAGUGUUUUCUUUUGCUAGAAGUGUUCUCCAACUUACUCUUCUUUU |
Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((((.(((((.(((((((.(.....((((....(((....)))....))))...).)).))))).))))..))))))...))))))))))))......... |
Contrafold
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
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.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
DotKnot
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[ FASTA input ] |
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((((((((((((.(((((((((((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))........))))))))...))))))...))))))))))))......... |
Fold
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[ FASTA input ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
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IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
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MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
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Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................................... |
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
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...........(((((((.........(((((.......)))))......))))))).......................................................... |
Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
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.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(20)
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.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
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.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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.......................................(((.....(((....))).....))).................................................. |
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
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((((((((((((.((((((..((((((((..........((((..................))))..........))))))))..))))))...))))))))))))......... |
RNASampler(20)
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[ FASTA input ] |
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.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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...............................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))............................................ |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((.((((((..((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))......))).))))))))..))))))...))))))))))))......... |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..(((((((((((.......)))))(((.(((........))).)))...........))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((((((((......)...(((((.......))))).((.(((.((...)))))))(((((((((....))))))..)))))).)))).)))))))))......... |
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.................................(.(..(.(........(.............(...).............)..........))........).)....).... |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................................................................(........(...............).....) |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
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