RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00075

RNA: SRP_00075
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	..(.((((((((.(((((.(((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....))))))).)))))))...)))))))))...
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)).)))..))))..)..))))))...))))))))))))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................((((....(((....)))....)))).........................................
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....)))))))..))))))...))))))))))))
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................((((((((((......))))))))))...................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(((((..(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))...)))))........
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................(((((((((((....))))))))))).........................................
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(((((((.((......)).)))))))......(((.........))))))))))..))))))...))))))))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((((.(((((.....((((.....((.....((((....(((....)))....))))...)).......)))).....)))))...))))))))....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((.((((((..(((((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....)))))))..))))))...))))))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(((((((.((......)).)))))))......(((.........))))))))))..))))))...))))))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.(((((.....))))).(((((((...[[[[.....))))))).(((((]]]].((((.....))))...))))).......))))))))))))
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................((((....(((....)))....)))).........................................
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((...)))))).(((((((...[[[[.....)))))))......]]]].(((....[[[)))....]]]........))))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(((((((.((......)).)))))))......(((.(......)))))))))))..))))))...))))))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)).)))..))))..)..))))))...))))))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(((((.....[[[[....[[[))).]]]....]]]]........)).)))))))..))))))...))))))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((((.((((.((((.((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...))).))..)))).)))).))))...)))))))))....
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((..............................(......(((....(((....)))....))))......................................)).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................((((....(((....)))....)))).........................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(((((((.((......)).)))))))......(.............))))))))..))))))...))))))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((...)))))).(((((((............))))))).((((((((.........)))......))))).......))))))))))))
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................((((....(((....)))....)))).........................................
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).)))).................
PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................((((....(((....)))....)))).........................................
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).)))).................
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................((((....(((....)))....)))).........................................
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................(((.....(((....))).....))).........................................
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...))).))..)))))))..))))))...))))))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(((((((............)))))))......((.((......)))))))))))..))))))...))))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((...)))))).(((((((............))))))).(((((.....((((.....))))...))))).......))))))))))))
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((...................................(((....))).....................................))))........
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))....................................
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................((((....(((....)))....)))).........................................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)).)))..))))..)..))))))...))))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)).)))..)))))))..))))))...))))))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(..((((.(((((((.((......)).)))))))......(((.........)))))))..)..))))))...))))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((..(((((((.(((((((((((((.(...((((((((((((..))))))))))))..)))).))).))))))).)))))))....)))))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(........................(.(..............(......((.......(....((...)).....)....)).....)..........)...))..
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(............((((((.(..(((....((((.....((((....(((....)))....))))..)))).....)))...)..)))))))..............
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(..((((....((.....((((....(((....)))....))))...))......))))..)..))))))...))))))))))))
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(((((((.(.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..)..)))))))..))))))...))))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((.((((((..(..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)).)))..))))..)..))))))...))))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((..((((.......)))).(((((((.((......)).))))))).......))))...((((....)))).......(((((......)))))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((..(((((.....))))).(((((((.((......)).))))))).[[[[..)))).(((.....)))(((..]]]])))(((......)))....

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