RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00076

RNA: SRP_00076
Rfam family: -

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((((((((.(((((.(((((.(((..((.(.....((((....(((....)))....))))...).))...))).))))..)))))).....))))))))))))))..........................(...(................................)...)..............................................
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((.....)))))...((((...((.((((..((((.((.....(((((((((.((((((..(((((((...)))))))..)))))).((((((......))))))))))).(((((.....)))))...))))...)).))))..)))).)).....))))))))).((((((..(((((((...)))))))..)))))).))))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((.((((((...((((((....((...((((((....(((....)))....))))....))..))..))))))..)))))).....))))))))))))))....((((((((((((.((((((...((((((....((...((((((....(((....)))....))))....))..))..))))))..)))))).....))))))))))))..
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..(((((((.......))))..(((.......)))....................)))...(((((((.((((((((.((((((((.((((((((((((((......)))))))..((((((((.....)))))..(((.......)))....................)))...))))))).)))))))).)))))))).))))))))))))))))
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................((((....(((....)))....))))...............................................................................................................................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.(((..((((.......))))..))).......((((....(((....)))....))))...(((((((.((((((((.((((((((.((((((((((((((......)))))))(((..((((.......))))..))).......((((....(((....)))....))))...))))))).)))))))).)))))))).))))))).))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((((((.....))))).(((((.....))))).....((....))......))))..(((((((.((((((((.((((((((.((((((((((((((......))))))).(((((((((.....))))).(((((.....))))).....((....))......))))..))))))).)))))))).)))))))).))))))))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((.....)))))...((((..(((.((((..((((....(((.((((((((((((((((..(((((((...)))))))..))))))..(((((......))))))))))).(((((.....)))))...))))..))).))))..))))....))).))))))))..((((((..(((((((...)))))))..)))))))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.(((..((((((...))))))..))).....((.((((..((((.((.(((....)))....((((((..(((((((...)))))))..)))))).((((((......)))))).(((..((((((...))))))..))).....)).))))..)))).)).(((....)))....((((((..(((((((...)))))))..)))))).))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((..((.........))...((.........))...................................((((((...((((((.....(((((((((((......)))))))))))..((.........))...................................................))))))...)))))).....)))))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.(((..((((((...))))))..))).....((.((((..((((.((.(((....)))....((((((..(((((((...)))))))..)))))).((((((......)))))).(((..((((((...))))))..))).....)).))))..)))).)).(((....)))....((((((..(((((((...)))))))..)))))).))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((((.........(((((.....)))))......)))))))(((((.....(((((((((((((((((((((.........((((((((((((......))))))))))))(((((((.........(((((.....)))))......)))))))))))).....))))))))))))))))))))).........))))))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((.....)))))...((((...((.((((..((((.((.....(((((((((.((((((..((((((.....))))))..)))))).((((((......))))))))))).(((((.....)))))...))))...)).))))..)))).)).....))))))))).((((((..((((((.....))))))..)))))).))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((..((((((...))))))..)))........((((..((((....(((....)))....(((((((.(((((((...))))))).)))))))(((((((......)))))))(((..((((((...))))))..)))........))))..))))....(((....)))....(((((((.(((((((...))))))).))))))))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((.(((((..........(((((.....)))))........)))))((((((....(((((((.(((((((((((((.........((((((((((((......))))))))))))((((((...))))))..((((..........)))).........))))))....))))))).))))))))))))).........))))))))))))))
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((.((((((...))))))...((((...((.((((..((((.((.....(((((((((.((((((..(((((((...)))))))..)))))).((((((......))))))))))).(((((.....)))))...))))...)).))))..)))).)).....))))))))).((((((..(((((((...)))))))..)))))).))))).))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((.....)))))...((((...((.((((..((((.((.....((((((((..((((((..((((((.....))))))..))))))(((((((......))))))))))).(((((.....)))))...))))...)).))))..)))).)).....))))))))..((((((..((((((.....))))))..)))))))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((.(((((((((((((.(...(((((((..(((..)))..)))))))....)))))))))))))).)))))).......(((((((((((......)))))))))))..(((((((.(((((((((((((.(...(((((((..(((..)))..)))))))....)))))))))))))).))))))))..)))).)))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((.....)))))...((((...((.((((..((((.((.....(((((((((.((((((..(((((((...)))))))..)))))).((((((......))))))))))).(((((.....)))))...))))...)).))))..)))).)).....))))))))).((((((..(((((((...)))))))..)))))).))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.(((((.....)))))...((((..(((...((((..((((..(((.(((((((((.((((((..(((((((...)))))))..)))))).((((((......))))))))))).(((((.....)))))...))))..)))...))))..))))..))).))))))))).((((((..(((((((...)))))))..)))))).))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........(((((.(((((.....))))).((((.....((((.......)))).)))).....))))).((((((..((((((.....))))))..)))))).((((((......)))))).((((.(((((.....))))).((((.....((((.......)))).)))).....))))..((((((..((((((.....))))))..)))))).........
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.....(((..(((((.....)))))..))).....((((.......)))).........))))...((((((..((((((.....))))))..)))))).((((((......)))))).((((.(((((.....))))).((((.....((((.......)))).)))).....))))..((((((..((((((.....))))))..)))))).........

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