RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00079

RNA: SRP_00079
Rfam family: Plant_SRP

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.(.(((..((((((((((((.((((((.(((....))))))..))))))))..........)))))))..(((((((..(((((((.(((((((((.(((((.((((.((((.((((((((.(((((((..(((....)))..)).))))).)))).......(((((....(((.((...(((....)))..)))))....))))).)))).))))..)))))))))))).)).))))))))))).)))))))....((..((((((....))))))..)).))).))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((..((((((((......))))))))...(((....))).)).((((((.....((..((((.(((((((((((((((.(((((.........)))))..(((((((((((.....((((((.((((((((((((....))))))).))))).))))))((((.(((((....(((((..((.......))..)).)))....))))).((((....)))).....))))....)))))))))))...)))))....))))))))))...))))...)).....))))))
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Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(.((((((((......)))))))).).((((()))))(((((..................)))))(((((((((((..(((((((.(((((((((.(((((.((((.((((.((((((((.((((((((((((....))))))).))))).)))))......(((((....(((((....(((....))).)).)))....)))))..))).))))..)))))))))))).)).))))))))))).)))))))....))))((((((....))))))...........
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((((......))))))))..........[[[[[[[[.))).(((......))).]]]]]]]].(((((((..(((((((.((((..(((((((((.((((.((((.((((((((.((((((((((((....))))))).))))).)))).......(((((....(((......(((....)))....)))....))))).)))).))))..)))))))...))))))))))))))))).)))))))...((((.[[[[[))))..]]]]]...........
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((....)).((((((((((((..(((((.(((....))))).)))..)))))..........)))))))..(((((((..(((((((.(((((((((.(((((.((((.((((.((((((((.((((((((((((....))))))).))))).)))).......(((((....(((......(((....)))....)))....))))).)))).))))..)))))))))))).)).))))))))))).)))))))...(((..((((((....)))))).....)))...
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(..(.((((((......)))))).....(((....)))))..((..((.((((((..((((.((((((((((((((....(((((....(..((((((.((.(((((.((((((((((((((((((((((((((....)))))).))))))))).))......(((((....(((.((...(((....)))..)))))....))).)))))))))))..)))))))....)))))))...))))).)))..)...).)))))))))...))))...)).)))))).)).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((......)))))))(((.(((....))))))....(((..................(((((((((((..(((((((.(((..((((((((((.((((.((((.((((((((.((((((((((((....))))))).))))).)))).......(((((....(((......(((....)))....)))....))))).)))).))))..))))))))...)))))))))))))))).)))))))....))))((((((....)))))).....)))...
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PPfold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((........))))).(...(((....)))..).(((((((((..((...(((.(..((((.(((((((.....(((......(((((((.((.(((((.((((((((.((((((.((((((((((....))))))).))).)))))).....(.(((((......((((...(((....)))..)).))....)))))).))))))))..)))))))....)))))))..))).....)))))))......)))).).)))......))..)))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((((...[[[))))))))...(((....((((((((.....(((......))).)))))))).(((((((..(((((((.(((((((((.(((((.((((.((((.((((((((.(((((((..(((....)))..)).))))).)))).......(((((....(((.((...(((....)))..)))))....))))).)))).))))..)))))))))))).)).))))))))))).)))))))....))).((((((....))))))......]]]..
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((((......))))))))..........((((((((..................)))))))).(((((((..(((((((......(((((((....((((.((((...((((((.((((((((((((....))))))).))))).)))))).....(((((..................................)))))......))))..))))......)))))))...))))))).)))))))........((((((....))))))...........
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................(((....)))................................((((((.....(((.......(((((((((...((((.((((((((.((((((..(((((((((....))))))).))..)))))).......(((((......(((....(((....)))....)))....)))))..))))))))..)))).))....)))))))...))).....))))))...................................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(.((((..((((((((((((.((((((.(((....))))))..))))))))..........)))))))..(((((((..(((((((.(((((((((.(((((.((((.((((.((((((((.(((((((..(((....)))..)).))))).)))).......(((((....(((.((...(((....)))..)))))....))))).)))).))))..)))))))))))).)).))))))))))).)))))))..)))).)((((((....))))))...........
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................(((....)))................................(((((((..(((((((.(((...(((((((((.((((.((((.((((((((.(((((((..(((....)))..)).))))).)))).......(((((....(((.((...(((....)))..)))))....))))).)))).))))..))))))))...))))).)))))))))).)))))))........(((((......)))))...........
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Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.(((((((......))).....((((....)))).))))..((((....((((...(((((((....))))))).(((((.........))))).))))..((((........))))..((((((((((((....))))))).)))))..(((.....)))..))))...)))..(((((.........(((((...........))))).....((((.....)))).)))))...((((..((.((......))..))..)))).((((......)))).....
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