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GGAGAGUAAGUCCUAUACAGCAUUCUCUUGCCCAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUCCGGUAAUGUGAGUGCGUGAUAUAGUCAGCUUGCUCUCCUUUU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))...))))))))))).... |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
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|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
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(((((((((((.(((((..((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))))....)))))...))))))))))).... |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
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.....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
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Mastr(seed)
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.......................................................................................................... |
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Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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|
McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
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[ FASTA input ] |
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..................................(((((.......(((((...........)))))........))).))......................... |
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Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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|
PETfold_2.0(20)
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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.............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).))))................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
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|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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(((((((((((.(((((((((((((..(((((......(((....(((....))).)))......)))))...)))))).)).)))))...))))))))))).... |
|
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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(((((((((((.(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))...))))))))))).... |
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RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.............................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))...................................... |
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RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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.....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
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(((((((((((.(((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))).).)))))).)).)))))...))))))))))).... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((.(((((((((((((.((((((......(((....(((....))).)))......))))).).)))))).)).)))))...))))))))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((...((((....(.(((((((((((((((..))))))))))))..))))...))))...)))))))))...))))))))))).... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.......................(.(....(((..((....(((....)))....))................).))....))...........)...))). |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....................................................................(.(.......(...................)...).) |
|
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))).).)))))).)).)))))...))))))))))).... |
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TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((((...((((.....((((....(((....)))....))))..))))....)))))).)).)))))...))))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((.(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))...))))))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((........((((..............)))).....(((((...........)))))..((((....))))..........))))))))))).... |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((........((((((.((((...........)))).(((((...........)))))......)))))).(((.....)))))))))))))).... |
