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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00084



RNA: SRP_00084
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))).)))).)))))...))))))).........))
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((.(((((((.(((...(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).....)))..))).))))....))))))...........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).))).))))...))))))))).........
Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................................................................................
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CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))....)))))............
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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).)))..))))..))))))))).........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).))).))))...))))))))).........
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).)))..))))..))))))))).........
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((.{{{{{{....)))..((([[[.)))(((....)))....]]]...........}}}}}}.....<<<<<<.)))))))))>>>>>>...
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((...((.(((.(((((.(.(((.....((((....(((....)))....))))..))).)...)))))..)))..))......))))))..........
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DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...))))))))).........
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))).)))).)))))...))))))))).........
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))).)))).)))))...))))))))).........
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MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...))))))))..........
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................................................................................
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..))))).)))).))))...))))))))).........
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((..((((((........(((((..)))))...........................))))))....)))))...))))))))).........
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((..((((((((((((....((((......))))...............))))))..))))))....))))))...)))))))).........
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RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .................................((((....(((....)))....))))..............................................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...))))))))).........
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...))))))))).........
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((...(.((((((((((((((((..)))))))))))).)))))..)))))))).)).)))))...))))))))).........
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(...................(....(....((((....(((....)))....))))...........................)........).).))....
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((..(......(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)..........)))))....)))))))).........
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)))).))))...))))))))).........
TurboFold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...))))))))).........
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...))))))))).........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...))))))))).........
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((....))))).((((......))))..((((......)))).................(((.........)))..(((((...((....)).)))))...
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((....)))....(((...[[[[[..((((....))))..........)))......]]]]]...........))).(((((.((.....)))))))....