|
|
|
GGCGGGCCUCCCCGCAUUGCACGGUAGCGAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGUUAUUCAGUGCAAGUGCCGGGGGUCGGGCUCGCCACCCCUCCC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))).)))).)))))...))))))).........)) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.(((((((.(((...(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).....)))..))).))))....))))))........... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).))).))))...)))))))))......... |
|
Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................(((....)))...................................................... |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))....)))))............ |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................(((((.....(((((((((((....)))))))))))..)))))....................................... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).)))..))))..)))))))))......... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).))).))))...)))))))))......... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...))))))))......... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).)))..))))..)))))))))......... |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((...(((.{{{{{{....)))..((([[[.)))(((....)))....]]]...........}}}}}}.....<<<<<<.)))))))))>>>>>>... |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((...((.(((.(((((.(.(((.....((((....(((....)))....))))..))).)...)))))..)))..))......)))))).......... |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...)))))))))......... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))).)))).)))))...)))))))))......... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))).)))).)))))...)))))))))......... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).))).))))...)))))))))......... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).))).)))))...))))))))......... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...)))))))).......... |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((......((..(....(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))......)...))..........))))))........... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..))))).)))).))))...)))))))))......... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((..((((((........(((((..)))))...........................))))))....)))))...)))))))))......... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((((....................................................................))))....)))))))......... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).))))...................... |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).))))...................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................(((.(...(((....)))....)))).............................................. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...)))))))))......... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..))))).)))).))))...)))))))))......... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((..((((((((((((....((((......))))...............))))))..))))))....))))))...))))))))......... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))......................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...)))))))))......... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))).)))).)))))...)))))))))......... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...)))))))))......... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((...(.((((((((((((((((..)))))))))))).)))))..)))))))).)).)))))...)))))))))......... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.(...................(....(....((((....(((....)))....))))...........................)........).).)).... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((..(......(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)..........)))))....))))))))......... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)))).))))...)))))))))......... |
|
TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...)))))))))......... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...)))))))))......... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))).)))).)))))...)))))))))......... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((....))))).((((......))))..((((......)))).................(((.........)))..(((((...((....)).)))))... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....)))....(((...[[[[[..((((....))))..........)))......]]]]]...........))).(((((.((.....))))))).... |