RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00093

RNA: SRP_00093
Rfam family: -

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.((..((..........))..)....(((((...)))))).......................................................................................((.(((((.(((((((((....))))))))).).)))).)).
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..)))))..(((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).))))).((.(((((((((....))))))))).))..))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..)))))..(((((((((((..((((((((((....((((((((....(((.....)))....)))).))))...)))))....))).....))..)))))))))))....))))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((..........(((((...(((((.....))).)).....))))).........((((((...(((.((((((((((...((((...........)))).)))))......))))).))).))))))...(((((((((....))))))))).....))))).
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(...........)...................................................................................................................(.(((((((((....))))))))).).........
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.....(((..(((((((.(((((......))))).......((..........((((((.......((((((((((...((((...........)))).)))))......))))).....))))))..........))......)))))))..)))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.((((....((((((...(((((.....)))).).....))))))...)))).((((((...(((.((((((((((...((((...........)))).)))))......))))).))).)))))).(.(((((((((....))))))))).)...))))).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((((...........)))).)))))......))))).))).))))))...(((((((((....))))))))).....))))).
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).)))))).(.(((((((((....))))))))).)...))))).
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).)))))).(.(((((((((....))))))))).)...))))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((........(([[[[....(((((......)))))....))]]]].........((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).))))))...(((((((((....))))))))).....))))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).)))))).(.(((((((((....))))))))).)...))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.....(((((((......(((((......)))))..)))))))..........((((((.......((((((((((...((((...........)))).)))))......))))).....))))))...........(((((.......)))))..))))).
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..)))))..(((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).))))).((..((((((((....))))))))..))..))))).
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...(((((((..((((((...).)))))...).))))))..))))).((((((.(.(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))))))))))...(((((((((....))))))))).....))))).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((....(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((.......((((((((((...((((...........)))).)))))......))))).....))))))...(((((((((....))))))))))))).......
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).)))))).(.(((((((((....))))))))).)...))))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).))))))...(((((((((....)))))))))..)))))....
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).))))))((..((((((((....))))))))..))..))))).
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((..((..)).((...((((((...))))))...(..))).......)))..)))((((((((.((((((.(((((((((.((......)................).))).))))))))))(.............))))))))))).))))).......
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...((((((...(((((......))))).....))))))..))))).((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).)))))).(.(((((((((....))))))))).)...))))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((.(((((...(..(((...(((((......))))).....)))..)..))))).((((((...(((.((((((((((...((.((..........)))).)))))......))))).))).)))))).(..(..(((((....)))))..)..)...))))).
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................(((((....((((.....))))....(((((....)))))....)))))...((((((((..((((....))))...........(((..((((........)))).....(((.....)))..((((....)))).))).))))))))...
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((..........((((.....((((.....))))....(((((....))))).....((((......{{{)))).(((...}}}...)))......))))..((((....[[[[)))).....(((.....))).(((((....))))).]]]]....))))).

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