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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00094



RNA: SRP_00094
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ((.((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....))).)..)))))))))......
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....)))...))))))))).....))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((....((((....((..(((...(((....))).....)))..)))))).....)))..)))))))))))).....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((..........................(((....)))....(((((......)))))......)))))))).........
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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((....((((((....(((.....(((....))).....))).).))))).....)))..)))))))))))).....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....))).)..)))))))))).....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((....(((((((...(((.....(((....))).....))))).))))).....)))..)))))))))))).....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.....................(((...(((....)))....((((((....))))))...))).))))))))))).....
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....)))..)))))))))))).....
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((....(((((..(((((((..)))..............))))..))))).....)))..)))))))))))).....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.....(((((........)))))...)))...................(((((.....((((((.............)))))))))))
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RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((..........(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))............)))))).........
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((((.(((..((..((.....))..))))))))).((.((((((....)))))).)).).)))))))))))).....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..(.(((((........))))))))..(((..)))((....))..((........))(((((((...........)))))))))...
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................(..(..........(........................(((....)))............)....)....)...
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........(.(.(((..(((((.....(((.(...(((....))).)...)))...))))).....)))...).........).....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((........(((((.....(((.....(((....))).....)))...)))))..........)))))))))))).....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....)))..)))))))))))).....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((....(((((.....(((.....(((....))).....)))...))))).....)))...))))))))))).....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((...((((...((.((..((.....))..)))).))))....((((((....)))))).......))))))))))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.....(((..((.((..((.....))..))))..)))....((((((....)))))).......))))))))))).....