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GGCAGCCGCAGGGGUCCCCUCGCGACGAAUUGCCGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGCGGUGGAUUUGGGUGCCGAGGUGCGGCUUUUGUGGCUGUCUUUU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
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|
DotKnot
|
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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|
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.........(((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..))))).))).))))...........)))))))).... |
|
MXScarna(20)
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|
Mastr(seed)
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.................................................................................................................. |
|
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
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|
MaxExpect
|
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|
McQFold
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................(((.....(((....))).....)))............................................... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
PETfold_2.0(20)
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
PETfold_pre2.0(20)
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PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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.........................................(((.....(((....))).....)))............................................... |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((..(((..((....(((....))).))...))).)))))).)))))..))).))))...)))))))))))))))).... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((..(((........(((....)))......))).))))).))))))..)).)))))...)))))))))))))))).... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((...(((((.........)))))....((((..(((((((......................))))))).....)))).)))))))))))))))).... |
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RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((((((..................................................................................))))))))))))...... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).......................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................(((((((.......(((((.....(((.....(((....))).....)))..))))).........)).)))))....................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((..((((((.(((((((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))).))))))..)).))))....)))))))))))))))).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((.((((((((..)))))))).))).)))))).))))).)))).))))).).)))))))))))))))).... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((.(((((((((.((.(((((..((((...((........(((....)))......))..))))..).))))..))..)))).).)))).))))))))))).... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((.(((((((.(((((((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))).))))))..)).)))))...)))))))))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
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