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Afold
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CRWrnafold
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CentroidFold
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CentroidHomfold‑LAST
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ContextFold
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Contrafold
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DotKnot
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Fold
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HotKnots
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IPknot
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MCFold
(ext)
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MaxExpect
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McQFold
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PknotsRG
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ProbKnot
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RNASLOpt
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RNAfold
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RNAshapes
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RNAsubopt
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RNAwolf
(ext)
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Sfold
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UNAFold
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Vsfold4
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Vsfold5
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