RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00123

RNA: SRP_00123
Rfam family: Metazoa_SRP

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((...)))))))...((((....))))...))))...((((((((..((((((((((((...((((((....((((..(((..(((..((((((((((((.((((.((..(((((((((....)))))))))..)).)))).......((.((((....(((....(((....)))....)))...))))))..))))).))))....)))..)))..)))...))))..))))))...))))))))))))..))))))))
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((...))))))))).((((....))))....)))...((((((((..((((((((((((...((((((((..((((..((...(((.((((((((((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))))......(((((.....((......(((....)))....)).....)))))..))))).))))....)))).)))...))...))))))))))))...))))))))))))..))))))))
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ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.......))))))....(((.......)))))))....(((((((..((((((((((((...(((((((..(((((.....(...(.(((((((.(((((.((((.((..(((((((((....)))))))))..)).)))).......(((((....(.(((....(((....)))....))).)..)))))..)))))..)))....)))).).....)....))))))))))))...))))))))))))..))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((...))))))))).((((....))))....)))...((((((((..((((((((((((...((((((((..((((..(((..(((.((((((((((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))))......(((((.....((......(((....)))....)).....)))))..))))).))))....)))).)))..)))...))))))))))))...))))))))))))..))))))))
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((.........))))..........(.........).....(((.(....(((((((((......((((.(((((((...((....(((((...(.(.(((.((((((.(((((.(((((((....))))))).))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))).)))..)...)))))))....)))).).).....).))))......)))))))))....).))).
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((...))))))))..((((....))))...))))...((((((((.....(((((((((...(((((((..(((((.......(((.((((((((((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))).......(((((....(((......(((....)))....)))....))))).)))))).))))....)))).)))........))))))))))))...))))))))).....))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((((((...))))))))).((((....))))..........((((((((..((((((((((((...((((((...(((((..(((..(((.((((((((((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))).......(((((....(((......(((....)))....)))....))))).)))))).))))....)))).)))..)))...))))).))))))...))))))))))))..))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((.....)))))))..(([[[.....))]]]))))...((((((((..((((((((((((...(((((((..(((((..((...(((.((((.(((((((..((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....)))))...)))).))).....)))).)))...))...))))))))))))...))))))))))))..))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((.....)))))))....((.........)).)))....(((((((..(((((.((..(((((((((((((((((((.(((((.((..(((.((((((((((.(((.(((((((((((((....))))))))))))).))).....((((...(.....((((....(((....)))....))))...))))).)))))).)))).....)))..)).))))))))))))))))))))))))..)).)))))..))))))).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................................................................................................................................................................................................................................................................
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((...))))))))..((((....))))...))))...((((((((..((((((((((((...((((............))))....((((((...(((((((............((((((((((.....))))))))))[[[[[[....((((......((((...(((....))).((((.......)))).)))).........))))))))))))))))).........]]]]]].))))))))))))..))))))))
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((((((...))))))))).((((....))))..........((((((((..((((((((((((...((((((((..(((((.....)))))...((((((((((((....(((((((((((((....)))))))))((((.((((..................))))...)))).......)))).......((((((.....)))))).....)))))))...)))))...))))))))...))))))))))))..))))))))
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................................................((.......(((((.((((((...((((((.........(((((((((.((((...((((((((((..(((((..((((((....))))))..)))))..))).....(.(((((......(((....(((....)))....)))....)))))))))))))........)))).))...))))))).....))))))...)))))).)))))......))..
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((...)))))))...((((....))))...))))...(((((..(..(..(((((((((...(((((..(..((((.((((..(((.((((((((((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))).))))....)))).)))..))).).)))))..)))))...)))))))))..)..)..)))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((.....(((..((((....))))..))).((((((((((......))).)))))))..))))).))))))))).(((..(((.((((((((((((((((((.(((..((((((((....))))))))..))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))).))))....)))).)))..)))..(((.(((((((........)))))))..))).......
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(.((((((((.....))))))))..((((.......))))((((...((.(((..(((((.(...((..))((((.(...(...).)))))((((((((((.(((((...(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))........((......))...((((...(((.(((.((((.((..)))))).).).).)))....))))))).)).))))))..))))(..).))))))))).))....))))..)....
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(..................................................................................(.(.(......).).).....(.........)..).(...............((..............(...............(((.(.(...((.................))..).)...................................)))............)..)).........)..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((...)))))))...((((....))))...))))...(((((..(..(..(((((((((...(((((.....((((.((((..(((.(((((((((((((.((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))).......(((((.....((......(((....)))....)).....)))))..))))).))))....)))).)))..))).).))))...)))))...)))))))))..)..)..)))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((...)))))))...((((....))))...))))...(((((..(..(..(..((((((...(((((..(..((((..(((..(((.(((((((((((((.((((.((..(((..((((....))))..)))..)).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....)))))..))))).))))....)))).)))..)))...)))))..)))))...))))))..)..)..)..)))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((((.....))))))))..(((....))).(((....)))....(((((((....)))))))......((((((.(((((.....)))))..)))))).((((........))))....(((......)))...((((..............)))).......(((((.((((((.....((((.......)))).((((..(((((..................)))))..))))............))))))..)))))...
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((.....)))))))..((((....))))...))))......((({{{...)))((((........))))....(((((.....)))))}}}......((((..<<<.<<))))..(((((....))))).((((..>>>>>...))))....((((...aaaaa((([[[[[[...............))).((.......))...)))).(((((.....]]]]]....))))).....(((...]AAAAA...)))....

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