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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00128



RNA: SRP_00128
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).))))).).)))))))))))))).......))
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .............(((.((((.((((((...(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))).))..))))...)))....................
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).))).))))...)))))))))))))))).......
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .................................................(((....)))..........................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)).)))))...)))))..................
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...............................((((......(((((((((((....)))))))))))...))))...........................................
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).))))).).)))))))))))))))).......
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.((((((.((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))...)))))...)))))))))))))))).......
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(...((((....(((....)))....))))).)))))).).)))).)).))))).).)))))))))))))))).......
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((....((((....((((((.[[[[[.....(((....))).....))))))..]]]]].))))...))))).....))))))))))))))).......
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ............(((...(((..........((((......((((....(((....)))....))))...)))).............))).....)))...................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((..((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...))))....)))))...)))))))))))))))).......
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).......
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).))))).).)))))))))))))))).......
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MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((.((((((((..))).)))))))))))))))))).)))).))).)))).).)))))))))))))))).......
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((........((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)))))).)).))))).).))))))........)).......
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((((((((((((((...(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))).)).))))).).))))))))...............
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................................................................................................................
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).......
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((..((((....((((((..((((......))))..........))))))........))))....)))))...)))))))))))))))).......
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Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................((((....(((....)))....))))..................................................
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PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................((((....(((....)))....))))..................................................
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PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).))).))))...)))))))))))))))).......
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..(((((([...(((((....(((....)))....))))])))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).......
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((..((((..((((((.....((((..................))))..)))))).....))))..)))))...)))))))))))))))).......
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................((((....(((....)))....))))..................................................
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RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................((((....(((....)))....))))..................................................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).))))).).)))))))))))))))).......
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).))))....)))))))))))))))).......
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).))).)))).).)))))))))))))))).......
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((...((((((..(..(((((..((((..))))..)))))))).))))....)))).)).))))).).)))))))))))))))).......
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (..................................(....(.(..(....(.........(......(.....)...)....)....).....).).......).)...........
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((((((.(((((..((((...((((......((((....(((....)))....))))...))))....))))....)))))...)))))))................
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).))))).).)))))))))))))))).......
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).......
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).......
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((.(((((.........)))))..((((......))))..)))......((((((.......)).))))..........))))))))))))))).......
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((.(((((......[[[)))))..((((......))))..)))......(((.((.]]]...)))))............))))))))))))))).......