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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00132



RNA: SRP_00132
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (..(((.(((((((((.((((((...(((.....((((....(((....)))....))))...)))....))))))))..)))))))....)))..)..
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..))))))))..)))))).))))))))))....
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..................................((((....(((....)))....)))).......................................
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((..(((.....((((....(((....)))....))))...)))...)))))))).))))))).)))))))))....
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CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..................................(((((((((((....))))))))))).......................................
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..))))))))).))))))).)))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..))))))))).))))))).)))))))).....
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..))))))))).))))))).)))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.....(((((((((.........((((.[[[[[[...........))))..]]]]]]))))))))).......)))))))))))....
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((...(.(...((((((..((((..))))..))))))..))....))))))))).))))))).)))))))))....
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.((....................((...(....((((....((......))....)))).........................)...)).))...).
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ........................................................(.(.........(................)..........).)
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..))))))))).)))))).))))))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..))))))))).))))))).)))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((.(((.....((((....(((....)))....))))...)))..))))))))).)))))).))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((((......))))).........((((((.................))))))....(((....)))...))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((....(((((......)))))....((((..[[[[[...........))))..]]]]].....(((....)))...))))))))))....