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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00134



RNA: SRP_00134
Rfam family: Bacteria_large_SRP

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CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .................(((.((((.(.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))...).)))))))...........................
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))....)))).))).))))))...))))))))))))....
Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................................................................................................
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CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((.(((((((((((((.(((((.....(((((((((((....)))))))))))..)))))...)))))).)).)))))....)))))))).........
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))....)))).)).))))))...)))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))....)))).))).)))))...)))))))).........
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))....)))))...))))))...)))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((.(((((((..(..(((.....(((....))).....)))).))))))..).)))).)).))))))...)))))))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((.....)))..((((((...[[[[[[....(((....)))....[[[[..))))))....]]]].....]]]]]]..)))))))))))))....
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DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((....(((.[[[.....)))..]]]...(((....)))(((.[[[[.....)))....]]]]....))))))...)))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))....)))).)).))))))...)))))))))))))....
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))....)))).)).))))))...)))))))))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))....)))).)).))))))...)))))))))))))....
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................................................................................................
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((....(..(.....(((....)))..)...)...))))))....)))).))).)))))...)))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((...(((..((((...))))))).......(((((...(((..........)))..))))).....))))))...)))))))))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((..((((..((((...)))).......................((((....))))...))))....)))))))...))))))))))))....
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RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((.(((((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))....)))))).)).)))))....)))))))).........
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))....)))).)).))))))...)))))))))))))....
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((.((((((.(....(((.((..((((..))))..)).))).).))))))...)))).)).)))..)))).))))))))))))....
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......(((((((((((((((((((.(..((((.....(((.....(((....))).....)))..))))....).)))).))).)))))...)))))))..........
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......(((((((.(((((..((((.(.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))...).))))....)))))....)))))).).........
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((.((((((..((((((..(((..(.....(((....)))..)...))).))))))....)))).))..)))))...)))))))))))))....
TurboFold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))....)))).)).))))))...)))))))))))))....
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UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))....)))).)).))))))...)))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.((((((((......((((.((........)))))).....((((....((((....)))).))))...)).))))))....))))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((...((((.......(((.....))).......................((((....))))...[[[.))))..]]]....)))))))))))))....