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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00136



RNA: SRP_00136
Rfam family: Fungi_SRP

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Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............(((((....((((((...............................((((((....))))))............(((.(((((((..(((((((((....((((...(((((.((....))))))).))))......................((((((((..((((....(((......)))....)))))))))))))))))))))...)))))))....)))........................................))))))..)))))......
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((...(((((........)))))..))))(((((((((.(((((..(((....)))..))))((((((((((((.((((((((.((((.((((.(((((((((((((((.((....))))))).).))).......)))))).........((((....(((....)))((((....((((())))))))))))).)))).))))..))))))))....)))..).))))))))).)))))))))....)))))...(.(((((((....))))))).)..
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((..(((...(((((........)))))..))).(((((((((..((((..(((....)))..))))((((((((.((..((((((((.((((.((((.(((((((((.(((((.((....)))))))...))).......))))))..........(..........)..((((((((((........))))))))))..)))).))))..)))))))).........))))))))))..))))))))).....))))..(..(((((((....)))))))..).
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((....((((........))))...))))(((((((((..((((..(((....)))..))))((((((((.((..((((((((.((((.((((.(((((((((.(((((.((....)))))))...))).......))))))........................((((((((((........))))))))))..)))).))))..)))))))).........))))))))))..)))))))))....))))).....(((((((....)))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((((...(((((........)))))..))))(((((((((..((((..............))))..((((.((((((((((((((.((((.((((.((((((....(((((.........))))).............)))))).((((..............)))).((((((((((........))))))))))..)))).))))..)))))))).........))))))))))..)))))))))....))))).....(((((((....)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((...((..(((((........)))))..))(.(((((((((..((((..(((....)))..))))((((((((((((.((((((((.((((.((((.(((((((((((((((.((....))))))).).))).......)))))).........(((((...(((....))).((((((........))))))))))).)))).))))..))))))))....)))..).))))))))..))))))))))...))))).(((..((((((....))))))..)))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))...((((.(..........)))))((((..((.(((((((((.(((((..((((..))))..)))...((((.(((...(((((((((((((..(((.((..((((.(((.(((((....(((..)).).(((((((.(......((........))......((((..))))))))))))..))))))))))).)..)))))..))))).))))))))..(((....)))))))))))))))))))))).).....))))..((((((((..))))))))....
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...)))))...................................................................................................(.......................................................((......)..).........................................(....((((....))).)........)....(.....................)...............).......
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((..........(((........)))........(((((((((..((((..(((....)))..))))((((((((.(((.((((((((.((((.((((.(((((((((((((((.((....))))))).).))).......)))))).........(((((...(((....))).....................))))).)))).))))..))))))))....)))....))))))))..))))))))).....))))......((((((....)))))).....
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((.....)))(((.(((...(((((........)))))..))).((((((((...((((..............)))).(((((..(((((...........)).))).(((....))).(((((.((....))))))).((((.........)))).....((((((.(((..(((((....)).)))(((........))).))).(((((((((....))).)).))))......)))))).)))))...))))))))....)))........((((((....)))))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....))))...((((....[[[[[[...)))).....((((...<<<....((((((.......((((aaaaaaa........)))).((((..AAAAAA.))))(((....))).(((((.((....))))))).A)))))).....)))).((((((.>>>]]]...bbb.))).)))(((BBB...))).......((((.(((.((((.{{{{{))))...))).}}}}}.............((((]]]...)))).))))......((((((....)))))).....