|
|
|
GGGGUAUUAUUGGUUUCUCGCAGCAGAAUUCAGCUUACUUAGUCAGGGCCGGAAGGAAGCAGCUUGGGUUGAAUUUCUGGGUGCCGGGAGUCGCUGGUAAUACCCCACCUUUUUGGUAAAAGGUAAUACCG |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((..((((((((((((...(.(((.....((....)).....))).)))))))).))))).)...))))))..)))))))))))))).........................
|
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.((((((((((((.....(((.....((....)).....)))..)))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((((((((((....(((.....((....)).....))).))))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(((((((((((((((((.(((((((((((((....(((.....((....)).....))).))))))))).))))..)).))))))..))))))))).............................. |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((..(((((.........((.(((.....((....)).....))).)).......))))).)...))))))..))))))))))))))((((((......))))))....... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((.((((((...((((((((((((((...(((..................)))))))))))).))))).....))))))...)))))))))))))((((((..[[[[))))))..]]]]. |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))))..)).))))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))).).)).))))))..))..))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....))))))))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....))))))))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((..((((((((((((...........................))))))))))))))).....))))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))))).)))..))).)))))..))..))))))))))(((((((.[[[)))))))...]]]. |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((..................))))))))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((............................(((((((....((((....))))..)))))))....))))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))).).)).))))))..))..))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))))..)).))))))..))..))))))))).(((((((....)))))))....... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((.(.((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))))))...).))).)))))..))..))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((((((((..(....(((((.((((..)))).)))))...))))))))).)))..)).))))))..))))))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....))))))))))))).))).).))).)))))..))..))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((.(((((((((((..(...(((.....((....)).....))))..)))))).)))))..)).))))))..))..))))))))))(((((((....)))))))....... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........(((.(((......))).....((((.........)))).....((((.((((....))))..)))).(((((((((......)))))...)))).((((((......))))))...))). |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(((......))).....((((.........))))..........((((....)))).(((((((.....))))))).)))))))))))))).((((((....))))))........ |