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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00140



RNA: SRP_00140
Rfam family: -

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((((((((((((..((((((((((((...(.(((.....((....)).....))).)))))))).))))).)...))))))..)))))))))))))).........................
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.((((((((((((.....(((.....((....)).....)))..)))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....))))))).......
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((((((((((....(((.....((....)).....))).))))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....))))))).......
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((((((((((((.(((((((((((((....(((.....((....)).....))).))))))))).))))..)).))))))..)))))))))..............................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((..(((((.........((.(((.....((....)).....))).)).......))))).)...))))))..))))))))))))))((((((......)))))).......
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....))))))).......
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.((((((...((((((((((((((...(((..................)))))))))))).))))).....))))))...)))))))))))))((((((..[[[[))))))..]]]].
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))))..)).))))))..))))))))))))))(((((((....))))))).......
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))).).)).))))))..))..))))))))))(((((((....))))))).......
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....))))))))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....))))))).......
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PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))))).)))..))).)))))..))..))))))))))(((((((.[[[)))))))...]]].
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.((((((((((((((...(((..................))))))))))))).))))..))).)))))..))))))))))))))(((((((....))))))).......
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))).).)).))))))..))..))))))))))(((((((....))))))).......
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))).)))))..)).))))))..))..))))))))).(((((((....))))))).......
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((((((.(.((((((((((((...(((.....((....)).....)))))))))))))))...).))).)))))..))..))))))))))(((((((....))))))).......
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((.(((((((((((..(....(((((.((((..)))).)))))...))))))))).)))..)).))))))..))))))))))))))(((((((....))))))).......
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((((((.((((((((((((((...(((.....((....)).....))))))))))))).))).).))).)))))..))..))))))))))(((((((....))))))).......
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..((((((((((.(((((((((((..(...(((.....((....)).....))))..)))))).)))))..)).))))))..))..))))))))))(((((((....))))))).......
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........(((.(((......))).....((((.........)))).....((((.((((....))))..)))).(((((((((......)))))...)))).((((((......))))))...))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((.(((......))).....((((.........))))..........((((....)))).(((((((.....))))))).)))))))))))))).((((((....))))))........