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CUCUUAUUUAGACCUAUGCAAUAGGAUUUUAGGGUAACGCUUCAGGGUAGGAAUACAGCAGAGUCCCCUAAUUUCUUGUGUGCCUUAGCCAUCUGAAUAGGAG |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.((.((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))))...).)))...))))))))))))
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.((..(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))...))...)))))))))))) |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................................................................................... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((.(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)).)))))...)))))....... |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.((.((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))))...).)))...)))))))))))) |
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Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((..((.((.(...(((....))).).)).)).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
|
Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((...)))))...((((((((.......((((.[[[[[[...........)))).]]]]]]....))))))))...)))))))))))) |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((............(((....))).........))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
|
MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))))))).))))))))...)))))))))))) |
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(.((((((.((((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..))))).))).))))...)))))).).... |
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Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................................................................................... |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((...)))))...((((((((.......((((..................))))...........))))))))...)))))))))))) |
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Murlet(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................(((.....(((....))).....)))....................................... |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))................ |
|
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))................ |
|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
|
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((........((((((..((((((...............................))))))..))))))............)))))))))))) |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).................................. |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
|
RNAsubopt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((...(((((.............)))))...(((.((((((((((....(......)...)))))...)))))))).((........)))))))))) |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............................(..(.(........(.((................(......)............))).........).)..).. |
|
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
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TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
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UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...)))))))))))) |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.....))))....(((((((.(((.......((((...............)))).......))))))))))....)))))))))))) |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((......((((.....))))......(((.....))).[[[[))))).....((((((..]]]]...))).)))....((((..........)))).. |