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GGUGACUCUAUUGGUCCCCUCGCGACGAUAGAUUGUGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGCAGUUGAUGCGGGCGCCGGGGUGUGGCUCUUAGAGUCGCCGCCCAACU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
((((((((((..((((.((((((..((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....)).)...)))))...))))..))))))))))........
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..)).))))).).))))..)))))))........))) |
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CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............((((...((.((....(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).....))..))..))))........................... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((.(((((((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..))).))))...))))..))))))))))........ |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................(((....)))........................................................... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)).)))))...)))))................... |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((.((((((..((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....)).)...)))))...))))..))))))))))........ |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((.(.((((((.......))))))((((((.(..(((((......(((.((....)).)))....)))))).))))))).))))..))))))))))........ |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.........((((((.......))))))((((((.....(((....)))..((((.{{{...)))).}}}[[[[..))))))........))))))))))]]]].... |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((.(((......((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))........))).))))...))))..))))))))))........ |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((.(((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..))).))))...))))..))))))))))........ |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((............(((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)).))).))).))))..............)))))........ |
|
MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(..........((((.((((.((.(((...(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))..))..))))...))))..)................. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((.((((((.......))))))[[[[[[....[[[[[...)))).((((.......))))...]]]]]..]]]]]]........))))))))))........ |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................((((((....(((((..........................)))))..)))))).......................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................(((.....(((....))).....)))................................................... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................((((....(((....)))....))))................................................... |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
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.........................................((((....(((....)))....))))................................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.........................................((((....(((....)))....))))................................................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
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.........................................((((....(((....)))....))))................................................... |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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..................................(.....)(((.....(((....))).....)))................................................... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((.(((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..))).))))...))))..))))))))))........ |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((.(((((((.((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)).))..))).))))...))))..))))))))))........ |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((........((((....))))..((((((....(((((........((((.......))))...)))))..))))))..))))..))))))))))........ |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................((((....(((....)))....))))................................................... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).............................................. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................(((.....(((....))).....)))................................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..)).))))).).))))..))))))))))........ |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((.(((.((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)).))..))).))))...))))..))))))))))........ |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..))).)))).).))))..))))))))))........ |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((((((((((((((((....((((((((((((..)))))))))))).)))))))))).))).)).))))).).))))))))))))))))........ |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(..........(((((.(((((...((....(((((.....(((.(...(((....))).)...)))..)))).)....)).....)))))...))))............)..).... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(..((((.(((((...((....(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).....)).....)))))...))))..)................. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..))).)))).).))))..))))))))))........ |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((.(((((((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..))).))))...))))..))))))))))........ |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..(((((((..(((.((...((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))....))..)))..)))...))))..))))))))))........ |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.....)))).(((((.((((...............))))..(((((........((((.......))))...)))))..))))).((((((.....)))))).)))..... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((....))))..((((.(((.[[[[........)))....]]]]..........)))).(((({{{.{{.))))......}}}}}.((((((((((.....))))).))))).... |
