RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00167

RNA: SRP_00167
Rfam family: -

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..((((.(((((...((((..((((...))))))))))))).(((((((.((((....((((((((((.((((((((....))))))))(((((((((((.(((..(((.(((((((((.(((((....)))))....)))))))))))).....))).((....)).)))))))).)))...........))))))).)))...((((((((.........)))..)))))......))))))....)))))..))))))..))..........
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((.((((.(((((...((((..(((....))).))))))))).(((((...((((((..((((((((((.((((((((....)))))))).))....((((((....(((.(((((((((.(((((....)))))....)))))))))))).........................(((....))).)))))).))))).)))..)))))).................((((.......))))......))))))))).)))..............
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...)))))....((....))))).....((((...((((.((((.(((((....((..(((.(....(((((.....(((((((.(((((.((((.(((((((((...(((((((.(((((....))))).)...))))))..))).....(((.(((.....((((....(((....)))....)))).))))))))))))..))))..)))))....)))))))..))).).)..).)))..)).))))))))).))))...))))...
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...)))))....((....))))).....((((...((((.((((.(((((....((..(((((..(..((((.((..(((((((.(((((..(((.((((..(((.((((((((..(((((....))))).....))))))))))).....(((.((((....((((....(((....)))....)))).)))).)))))))..)))...)))))....)))))))))))).).)..)))))..)).))))))))).))))...))))...
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((((((...((((..((((())))).))))))))))(((((.((((((((..((((((((((.(((((((((()))))))))).))....((((((....(((.(((((((((((((((....))))).)..)))))))))))).........((....))........(((....))).)))))).))))).)))..))))))....((........)).((((.......))))....))))))))))).)))..))..........
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...))))).........[[[)))..]]]((((...((((.((((.(((((.....((((...(((((((((((....))))))))(((((.((((((((((((((.(((((((((.(((((....)))))....))))))))))))(((...)))((((....((((....(((....)))....)))).)))))))))))...))))..))))).....)))((((.......)))).))))....))))))))).))))...))))...
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.(((((...)))))))))))((....)).((((...((((.((((.(((((.....((((.((((.((((((((....))))))))..(((((.((.(((((.(((.(((((((((.(((((....)))))....)))))))))))).........((....))((((....(((....)))....))))...(((((.(((.....))))))))...))))).)).)))))...)))).))))....))))))))).))))...))))...
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((...)))))).........(((((((...............(((((.((((((..(((((((((..(((((((((..))))))))).......((((((........(((((((((.(((((....)))))....)))))))))(((((.............((((......)))).))))).)))))))))))).)))..))))))............)))))((((.......))))....)))))))..(((....)))..........
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.(((((...))))))))))).........((((...((((.((((.(((((.....((((.((((.((((((((....))))))))(((((((....(((((.(((.(((((((((.(((((....)))))....))))))))))))..........(((....((((....(((....)))....)))).)))((((.(((.....)))))))....)))))....))))).)))))).))))....))))))))).))))...))))...
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.(((((...))))))))))).........((((...((((.((((.(((((.....((((((((..((((((((....))))))))(((((.(((((((((((....(((((((((.(((((....)))))....)))))))))..................((((......))))...................)))))))...))))..)))))....))))((((.......)))).))))....))))))))).))))...))))...
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((...))))........((.(((....))).))))).((((.((((.(((((.....((((.((((.((((((((....))))))))..(((((.((.(((((.(((.(((((((((.(((((....)))))....)))))))))))).........((....))((((....(((....)))....))))...(((((.(((.....))))))))...))))).)).)))))...)))).))))....))))))))).))))..........
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...)))))....((....))))).....((((...((((.((((.(((((....((..(((((((((((((((....))))))))(((((.((((.(((((((((.(((((((((.(((((....)))))....)))))))))))).....(((.((....))((((....(((....)))....))))....)))))))).).))))..))))).....)))((((.......))))))))..)).))))))))).))))...))))...
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.(((((...))))))))))).....(((.....)))(((((((((.(((((..((((.(((((...(((((((((..)))))))))...)))))))))..(((((((((((((((((((((((..)))))).(((...)))((((((((..)))).)))))).))))))))))))..((((((.(((......))).((..)).).)))))....(.(((.((..(..))).))).))))((..))..))))))))))))))((((..))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.(((((...))))))))))).........((((...((((.((((.(((((.....((((.((((.((((((((....)))))))).................(((.(((((((((.(((((....)))))....)))))))))))).........((....))((((....(((....)))....)))).............................................)))).))))....))))))))).))))...))))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.(((((...))))))))))).........((((...(((..((((.(((((.....((((.((((.((((((((....))))))))..((((..((.(((((.(((.(((((((((.(((((....)))))....)))))))))))).........((....))((((....(((....)))....))))...(((((.(((.....))))))))...))))).))..))))...)))).))))....)))))))))..)))...))))...
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.((((.....))))))))))..(((((......))))).(((((.((((......))))..((((.((((((((....)))))))).((((.((((.....))))..(((((((((.((((......))))....)))))))))........(((.......((((......))))...((((...((.........))...)))).))).))))..))))...((((.......))))......)))))......................
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.((((.....))))))))))..(((((......))))).(((((.((((......))))(((((((((((((((....)))))))).((((..(((.....))){{{))))...}}}(((((....)))))........)))))))......<<<<<<....((((......))))...(((.((........[[[[[[..)))))..]].]]]].........((((.......))))......))))).....>>.>>>>..........

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