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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00168



RNA: SRP_00168
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((((..........))))))....(((((..(((..((((.(((((..(((((..((((...)))).)))))..((((((((((((.(((((((....(((((.(((...(((((((....)))))))((((((((((((.......))).)).....((((....(((....)))....))))..)))))))..))))))))..))))..)))....)))))))))...))).........)))))))))..)))..)))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((...)))))....................((((((.((((.((((.(((((....(((.(((((..((((((((....)))))))).......((((((...(((((.((((((((((((((....))))))).......(((..(((....))).)))...))))))).))))).......))))))))))))))...........................(((((.....))))).........))))))))).)))).))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((...)))))....((....))........((((((.((((.((((.(((((....((...........(.(((.....(((((((.(((((..(((.(((((((((((...(((...(((((....)))))......)))..))))).....(...((.....((((....(((....)))....))))..))..)))))))..)))...)))))....)))))))..)))...).........)).))))))))).)))).))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...)))))....((....))))).....((((((.((((.((((.(((((....((..(((((..(..((((.((..(((((((.(((((..(((.(((((((((((.(.(((((((((((....)))))))...)))).)))))).....(((.(((....((((....(((....)))....)))).))))))))))))..)))...)))))....)))))))))))).).)..)))))..)).))))))))).)))).))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((...)))))(.......)...........((((((.((((.((((.(((((((..(((.(((((..(((((((((()))))))))).......((((((((.(((((.((((((((((((((....)))))))..((((()))))(((....))).......))))))).)))))..))...))))))))))))))....)).....(.............).(((((.....))))).........))))))))).)))).))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...)))))............))).....((((((.((((.((((.(((((.....((((((((..((((((((....))))))))(((((..(((.....)))((((.(((...(((((((....)))))))((((((((((..(((....))).)))....((((....(((....)))....))))..)))))))..)))))))...)))))....))))(((((.....))))).))))....))))))))).)))).))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((...))))))...((....))........((((((.((((.((((.(((((.....((((.(((((((((((((....))))))))..(((((.((.(((((..((((((...)))))).((((((.((((((((((((((((..(((....))).)))....((((....(((....)))....))))..))))))).)).)).)).))))))...))))).)).))))).)).))).))))....))))))))).)))).))))))....
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((......[[[))............]]].....((((((.((((.((((.(((((...(((..<<<<<..<<))).............>>.((((..(((.......(((((.{{....(((((((....))))))){{{{{{{{{)))))..........}}....((((....(((....)))....))))..}}}}}}}...}}.)))...)))).......................>>>>>.....))))))))).)))).))))))....
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((...))))))...((....))........((((((.((((.((((.(((((....((((.(((((((.((.(((.....((((.((....(....(..((..(((((.((((((((((((((....))))))).(....)(((..(((....))).)))...))))))).)))))...))).)..))))))..))))).))).)))).))))...........(((((.....))))).........))))))))).)))).))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((...))))))....(((..(((((...(((((..((((((...(((((((.....(((.(((((..(((((((((..))))))))).......((((((...(((((.((((((((((((((....)))))))..((((..))))........[[[[[....))))))).))))).......)))))))))))))).))))))).))))))............(((((.....))))).)))))))))))))]]]]]...............
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((...))))))...................((((((.((((.((((.(((((....((((.((((..((((((((....)))))))).......((((((...(((((.((((((((((((((....)))))))..((((.....))))..............))))))).))))).......))))))...............)))).))))...........(((((.....))))).........))))))))).)))).))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...)))))....((....))))).....((((((.((((.((((.(((((.....((((((((..((((..((....))..))))(((((..(((.....)))((((.(((...(((((((....)))))))((((((((((..(((....))).)))....((((....(((....)))....))))..)))))))..)))))))...)))))....))))(((((.....))))).))))....))))))))).)))).))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((..)))).).))))))...(..)..((((((.(((((((((.(((((((..)((.((((((((((((((((..))))))))))).....((((((.....(((..)))(((((((((((..)))))))).)).(((((((((.............)).)))))))..((..)))(..)))))))))))))).(((.(((((.((((((...).)).)).))))).).))).)...((..))..)))))))))))))).))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((...)))))............))).....((((((.((((.((((.(((((...............((((..((....))..))))..(((((.((.(((((..(((((.....))))).((((((.((((((((((((((((..(((....))).)))....((((....(((....)))....))))..))))))).)).)).)).))))))...))))).)).)))))................))))))))).)))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((((...)))).....((....))))).....((((((.(((..((((.(((((..(((((((.(.....).)).)))))..((((((((((((..((.((((((((((((.(((...(((((((....)))))))((((((((((..(((....))).)))....((((....(((....)))....))))..)))))))..))))))))..)))....))))))))))))))...)))).........)))))))))..))).))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((.....)))))...((((...(((((.....))))).))))...(((((((.(((.(((.........))).(((....))))))...((((..(((.....)))(((((.....)))))...)))).(((((((.((((.....)))).............((((......))))............)))))))...)))))))....((((.((........(((((.....)))))....(((........))).)))))).........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((.....)))))...((((...(((((.....))))).)))).((((..(((((...(((.{{{{{...))).(((....)))..((((((.((((((((.....)))).[[[[(((.((((((....))))))<<<<)))...>>>>.......))))....((((]]]]..))))....))))))...}}}}}........)))))..((((...........(((((.....)))))...(((((.....)).)))..))))..))))...