RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00180

RNA: SRP_00180
Rfam family: -

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((...((((((((.((..((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).))))))((..)).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....))))))))))......................................................
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((((((.(((.((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))))).....((((......))))..(..((((..(((((......)))))))))..).)))))))))..)))))))....))))))))...)).....((((.((((((.((....))))))))..)))).............)
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((..(((.(((..(((((((.(((((....((((((((..........)))))))).....)))))..((((((((...)))....(((((..(((((......))))))))))))))))))))))...)))))).....))))))).((.......(((..((((((.((....))))))))...)))........))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((.(((.((((.((((((((((((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))).)))...((((......))))....(((((..(((((......))))))))))...)))))))))..)))))))....))))))))...........((..((((((.((....))))))))...))...............
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((.(((.((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).))))))......................................................)))))))))..)))))))....))))))))........................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.((((((((.((..((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).))))))(....).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....)))))))).............................(((...............))))))...
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((.((((((((.(((.((((.((((((((((((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))).)))...((((......))))....(((((..(((((......))))))))))...)))))))))..)))))))....)))))))).).)......((((.((((((.((....))))))))..))))..............
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((.(((.((((.(((((((.((((((((.((((((((..........)))))))).))).)))))..((((((((...)))....(((((..(((((......))))))))))))))))))))))..)))))))....))))))((((........((((.((((((.........))))))..))))....))))......
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((..(((.((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))))).....((((......))))....(((((..(((((......))))))))))...)))))))))..))))))).....)))))))..........((((.((((((.((....))))))))..))))..............
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((.(((.((((.((((((((((((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))).)))...((([[......)))....(((((..(((((......))))))))))]].)))))))))..)))))))....))))))))..........((((.((((((.((....))))))))..))))..............
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((..(((.((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))).))....((((......))))....(((((..(((((......))))))))))...)))))))))..))))))).....)))))))..........((((.((((((.((....))))))))..))))..............
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((...(((((..(((((((((.((((((.((((((((..........)))))))).)))))).....((((......)))).((((((..))))))..((((........))))..))))))))).......))))).))))))))...............((((((.........))))))..))))).............
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((..((((((((.(((.((((.(((((((((.((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))))).....((((......))))....(((((...((((......)))).)))))...)))))))))..)))))))....))))))))...)).....((((.((((((.((....))))))))..))))..............
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((.(((.((((.((((((((((((((((.((((((((..........)))))))).)))).)))...((((......))))..(.(((((..(((((......)))))))))))..)))))))))..)))))))....))))))))..........((((.((((((.((....))))))))..))))..............
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((((((.....((((.(((((((((.((((((.((((((((..........)))))))).)))))).....((((......)))).(((((....)))))....................)))))))))..)))).......))))))))..........((((.((((((.........))))))..))))..............
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((.(((.((((.(((((((.((((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))).))))..((((((((...)))....(((((...((((......)))).)))))))))))))))))..)))))))....))))))((((..((....((((.((((((.((....))))))))..))))))..))))......
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((..((((((.((((..((((((((.(((((..((((((((..(...)...))))))))..))).(((((.((((..(..))))).)))))(((..(((((......))))))))...))))))))))...)))))))((..(((....................((((((.((....)))))))))))))...).))))).....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((((..(((.((((.((((((((((((((((.((((((((.((....)).)))))))).)))).)))...((((......)))).....((((..(((((......)))))))))....)))))))))..))))))).....)))))))..........((((.((((((.((....))))))))..))))..............
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((..(((((((..(((.((((.((((((((((((((((.((((((((.((....)).)))))))).))).))))...((((......))))....(((((..(((((......))))))))))...)))))))))..))))))).....)))))))...)).....((((.((((((.((....))))))))..))))..............
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((.............)).)))).(((((((..((((((((.((....)).))))))))..))).))))..((((......))))..((((....)))).((((((...((.....))..))))))...(((((...(((((.((.......))))))).((((.((((((.((....))))))))..))))......)))))...
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((.............)).)))).(((((((..((((((((.((....)).))))))))..)).)))))..((((.<<<<.)))).(((((....)))))..((((..[[[[[.))))(((((]]]]..)))))...((((..{{{.{{.)))).......}}}}}....]>>>>....((((..........)))).........

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