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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00196
RNA: SRP_00196
Rfam family:
-
| GCCCAUUAUUAUGUGAAAAAUAUCUCUUAACAUGUCAGGACAUAAAUGUAGCAGCAUAAAGAAAUUUAUUUUUUUAGAUAUAAUAAAUGGGCCAACA | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((..((((.(((.((.((.(((....((((....(((....)))....))))..))).)))).))).......))))...)))))))..... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...)))))))).))))))..... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..(((....((((....(((....)))....))))..)))....))))))))...))))))))).)))))..... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((....(((....(((....)))....)))..))))....))))))))...)))))))).))))))..... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((.(((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))....)))))))....)))))))).))))))..... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((.((((((((.........((((....(((....)))....)))).((....))))))))))....)))))).)))))))..... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....(((....)))....)))).))))....))))))))...)))))))).))))))..... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((((..........[[[[.)))))..]]]]...............(((((....)))))................)))))))..... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...))))))).)))))))..... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....(((....)))....)))).))))....))))))))...))))))).)))))))..... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....(((....)))....)))).))))....))))))))...))))))).)))))))..... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((.....((((....(((....)))....)))).[[))..]]))))))))...)))))))).))))))..... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....(((....)))....)))).))))....))))))))...)))))))).))))))..... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((............(((((.......(((((..))))).............(((((((((..))))))))))))))....)))))))..... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((...((((..((((............)))))).)).(((((....)))))))))))..))))))).)))))))..... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...))))))))).)))))..... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....(((....)))....)))).))))....))))))))...)))))))).))))))..... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..............................................................................)))))))..... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.......((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...........)))))))..... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...))))))).)))))))..... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...))))))).)))))))..... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...))))))))).)))))..... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((((((((.(...(((((..((....))..))))).).)))).)).))))))))..)).)))))).))))))..... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....))))..((((....)))).))))....))))))))...)))))))).))))))..... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((((..((((...((((....(((....)))....)))).))))....))))))))...))))))))).)))))..... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((((.....)))).((((...((((....))))..((((....)))).)))).(((((......)))))......)))))))..... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...((((.....)))).((((...((((....))))..((((....)))).)))).(((((......)))))......)))))))..... |