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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00198



RNA: SRP_00198
Rfam family: Archaea_SRP

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Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(((((((..((((.((((((.....)))))).....((((..(((...)))...))))))))...(((..(((..(.((.(((.......(((((.((((...((((....))))((((((((...((...((((((((.((((((.((..(((((....)))))..)).))))))....(..(((.....((((....(((....)))....))))..)))..))).))))))))..)))))))).)))).)))))..(((((.((((....)))).)))))...))).)).)..)))..)))..)))))))))..
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(((((((..(((((((((((.....)))))))....((((..(((...)))...))))))))...(((..(((..(.((.(((.......(((((.((((...((((....))))((((((((...((...((((((((.((((((.((..(((((....)))))..)).))))))....(..(((.....((((....(((....)))....))))..)))..)))).)))))))..)))))))).)))).)))))..(((((.((((....)))).)))))...))).)).)..)))..)))..)))))))))..
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.((((((((((((((((.((.((((.(((((..))))))))..(((((.(((((.(((((((((.((.((.(((((((.(((...((...))(((((..........((((((..))).(((((((((((......).)))))...))))).)))))))).)))...)))))...)).).))).(..)...(((((((((((((..)))))))))))).)((..))((((((...))))))((((((.(............)))))))))))))))))))))...)))))...))).)))).))))))))))))))..
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(((((((..((((((((..........................................................................((((.((((...((((....))))((((((((...((...((((((((.((((((.((..(((((....)))))..)).))))))....(..(((.....((((....(((....)))....))))..)))..))).))))))))..)))))))).)))).)))).......................................))))).)))..)))))))))..
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(((((((..((((((((....(((.((((....))))))).((((...(((((.((((((((.........((........))...(((((((((.((((...((((....))))((((((((...((...((((((((.((((((..(..(((((....)))))..)..))))))....(..(((.....((((....(((....)))....))))..)))..))).))))))))..)))))))).)))).))))......))))).))))))))))))).....)))).....))))).)))..)))))))))..
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((......))).((((.....)))).((((....))))......((((......))))..((((................)))).......(((((((......((((....)))).(((((((((.....)))))).(((....))).)))..))))))).((((...............)))).....((((.......))))....(((((........((((....)))).(((.(((....)))(((.((((...((((..((((....))))..)))).....))))....)))..))).))))).......
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((......)))).((((((((..[[[))))))))...((((.....]]]......)))).(((({{{{{...........))))........(((.....))).((((....))))....((((((.....)))))).(((....))).}}}}}..(((((.<<<<..)))))........>>>>.....(((((....)).)))....(((((........((((....)))).(((.(((....)))....((((.....aaaa((((....)))).aa.))))..AA.....AAAA...))).))))).......