 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00215
RNA: SRP_00215
Rfam family:
Bacteria_small_SRP
| GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((((.(((((((.((.....((((....(((....)))....))))...)).)..))))))))..))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((........(((((....(((...((..........)).)))(((((...))))))))))))))))))).... |
| CMfinder(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((....(((....)))....)))).............................. |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((..((.....((((....(((....)))....))))...))....))))))).))))))))).... |
| Carnac(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .................................(((....)))...................................... |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (.(((((((((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...)))))).))))))).).... |
| CentroidAlifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................(((((((((((....))))))))))).............................. |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((((((((((..(.((.....((((....(((....)))....))))...)).)....))))).))))))))..... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((.((((((((.((.....((((....(((....)))....))))...))...)))))))..))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((..(.....((((....(((....)))....))))...)....)))))))).))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((................(((....)))................)))))))).))))))))).... |
| DAFS(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((....(((....)))....)))).............................. |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((((...))))).(((((((((((((....)))))))))))))))))))).))))))))).... |
| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((.(((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))))..))))))).)))))).)).... |
| MXScarna(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((.....................((((....(((....)))....))))......................))...... |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ................................................................................. |
| Mastr(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((....(((....)))....)))).............................. |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((.....(((......))).........................)))))))).))))))))).... |
| Multilign(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.....(((((................................................)))))......)))).... |
| Murlet(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((....(((....)))....)))).............................. |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((((((((((((.((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...))))...)))))).))))))....... |
| PETfold_2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((....(((....)))....)))).............................. |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((((((((((((.((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...))))...)))))).))))))....... |
| PETfold_pre2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((....(((....)))....)))).............................. |
| PPfold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................(((.....(((....))).....))).............................. |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((...((.((......))(((....))).((........)).)))))))))).))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((..........................................)))))))).))))))))).... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((..................))))........)))))))).))))))))).... |
| RNASampler(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((....(((....)))....)))).............................. |
| RNAalifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..................((.....(((.....(((....))).....)))...))......................... |
| RNAalifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .........................((((....(((....)))....)))).............................. |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((.......(((((((((((((..)))))))))))).)......)))))))).))))))))).... |
| RSpredict(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .................(((.....((((....(((....)))....))))..............))..)........... |
| RSpredict(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...............................................(.(................(........)..).) |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| TurboFold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((........((((....(((....)))....))))........)))))))).))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((.................(((..................))).(((.....)))......))))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((.((..............(((..................))).(((.....)))....))))))))))).... |