 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00219
RNA: SRP_00219
Rfam family:
Bacteria_small_SRP
| GCCAUUAGAAUAGCAACCUUGUAACUUGGUCAGGACAGAAAUGAAGCAGCCACAUCGAGAAGUGUUAUGUCUAAUGGUUUUU | |||
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | (((((((.(.(((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...))))))...))))))).... | |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((..................))))...))))...)))))).))))))))).... |
| CRWrnafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((.((((((.....((((..................))))...))))..))))))).))))))))).... |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))..)))))).)))))))...... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((.(((((.....((((.....((....)).....))))...))))..))))))).))))))))).... |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((.(((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...))))))..)))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((.(((((.....((((.....((....)).....))))...))))..))))))).))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((........((((...[[[[[[))))................(((]]]]]]..))).....))))))))).... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((..................))))...))))...)))))).))))))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((((..(.((((((..)))))))((((((...)))))))))))).)))))).))))))))).... |
| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (.((((((((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))..)))))).)))))).)).... |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .................................................................................. |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((.........((((((.......................))))))...)))))).))))))))).... |
| PETfold_2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))..)))))).))))))....... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))..)))))).))))))....... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((..(((............))).((....))..((..............))))))).))))))))).... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((.(((((.....((((..................))))...))))..))))))).))))))))).... |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((((((((((((..((((.....((((((.........))).....)))...))))...)))))).))))))))..... |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((..................))))...))))...)))))).))))))))).... |
| RNAalifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))........................ |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((((.(....((((((..(((..)))..))))))...))))).))))))))).)))))))).... |
| RSpredict(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (..............(.......(..((.................(................)........)).)...).). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((..((((.....((((.....((....)).....))))...))))...)))))).))))))))).... |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((.(((.....)))......(((..................))).(((......))).....))))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((.(((.....)))......(((..................))).(((......))).....))))))))).... |