|
|
|
GGCGGGUCUCCCCGCAUGGCAAAUCGGAACACCGGGUCAGGGGCGGAAGCCAGCAGCCCACUCCAAUGCGCCAGUGCCGGGGGUUUGGCCCGCCGCCCUAUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((((((((.((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))))...))))))...))))))))........
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).)).))))))...))))))........)) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((.(((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).))).))))....)))))))......... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((.....(((.....((((....(((....)))....))))..))).....)))).))).)))))...))))))))........ |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((........((((.....................(((....)))..................)))).............))))))))........ |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).)))))).)).)))))....)))))........... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((((((((((......(((((((((((....)))))))))))...))))))))))).)).)))))...))))))))......... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).))).)))))...))))))))........ |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).))).)))))...))))))))........ |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((.((((.....(((.....((((....(((....)))....))))..))).....)))))...))))))...))))))))........ |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).))).)))))...))))))))........ |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((..((((.............((((....((([[[.)))....))))..]]].....))))....))))))...))))))))........ |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).)))))).)).))))))...))))))))........ |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((.....(((.....((((....(((....)))....))))..))).....))).))).))))))...))))))))........ |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).)).))))))...))))))))........ |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).)).))))))...))))))))........ |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).))).)))))...))))))))........ |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((((..((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))).)).))))))...)))........)))). |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((.((((.....((((....(((....)))....))))..)))).))))))).))).))))...)))))))))........ |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))))).)).)))))...)))))))))...... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).))).)))))...))))))))........ |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((..((((...((((....)))).....((((...........))))..........))))....))))))...))))))))........ |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).)).))))))...)))))))......... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).)))))).)).))))))...)))))).......... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..))))).)))))).)).))))..................... |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..))))).)))))).)).))))..................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).))).)))))...))))))))........ |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((.....(((.....((((....(((....)))....))))..))).....)))).))).)))))...))))))))........ |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((..((((...((((....)))).....((((...........))))..........))))....))))))...))))))))........ |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.................................(((....)))...................................))))))))........ |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))...................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((((((((((((.((((......((((....(((....)))....))))...)))).)))))).)).))))))...)))))........... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).)).))))))...))))))))........ |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).)).))))))...))))))))........ |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((.....((....))((((....(((....)))....))))..........)))).))).)))))...))))))))........ |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((...((...((.(((((((((((..)..)))))))))))).)).)))..))).)).))))))...))))))))........ |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.......................((....(....(.....((.............................))....)......).....))..)).... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((..((((...(.(((.....((((....(((....)))....))))..))).)...))))....)))))....))))))))........ |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).))).)))))...))))))))........ |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).)).))))))...))))))))........ |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))..)))).)).))))))...))))))))........ |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((....)))))..((((..((((....)))).....((((...........))))...............)))).(((((..((....)))))))... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((....)))))..((((..((((....)))).....((((...........))))...............)))).(((((..((....)))))))... |
