|
|
|
GCCCAUAGAGGAGGAUCUUCAACGUUUUGAAGAUGUGUCAGGACUGAAAAGAAGCAGCACGCAAAACGCUUCGAAGUCGCCCCCAUUCUAUGGGUGCCGUACC |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
((((((((((..((...((.((.((.((.....(((((.....((....)).....)))))...)).)))).)).......))..))))))))))........
|
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((..((((((((....))))))))...))..((((.....(((((............)))))..)))).......))))))))))........ |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.(((((((((((((.(((((......((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)))))))...)))))........... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((((((((((....)))))))).......((((.....(((((.(.........))))))..)))).)).)..))))))))))........ |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..)))).......))))))))))........ |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((........))))))((((.....((....)).....)))).....................))..))))))))))........ |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((((((((((....)))))))).......((((.....(((((.(.........))))))..)))).)).)..))))))))))........ |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..)))).......))))))))))........ |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..((.(((.((.(..............((((....(((....)))....)))).......)....))..)..)).))....)))))))........ |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..)))).......))))))))))........ |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..)))).)).))..)))))))))........ |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..))))...))..))))))))))........ |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((..((((..(((((((.....((((.....((....)).....)))).)))))))....))))...)).))..)))))))))........ |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(..((((((.((((((.(((((((((((......((((....(((....)))....))))..)))).)).))))).)).))...)))))).)).)........ |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................................................................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.((((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..)))).)).))..)))))))))........ |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((....))))))))...((((..))))...(((((............))))).............))))))))))........ |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((.[[[))))))))((((...{{{{.....{{{{{.))))<<..]]]}}}}}..}}}}<<))...))))))))))>>.>>... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((.(((((......(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)))))).................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((.(((((......(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)))))).................... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..))))...))..))))))))))........ |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.....((((((((.[[[)))))))).......((((.....(((((.........]]])))))..))))........)))))))))........ |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..)))).......))))))))))........ |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................(((......(((.....(((....))).....)))..)))...................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..))))...))..))))))))))........ |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..))))...))..))))))))))........ |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..))))...))..))))))))))........ |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.((.((..((((..(((((((.((.(((((...(......)....))).)))))))))))....))))....))))...))))))))........ |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(....................(....(.(..(...(..............(................).......).)..).)......)..)....... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((......(((((((....)))))))........((((.....(((((............)))))..))))........)))))))))........ |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((((((((((....)))))))).......((((.....(((((............)))))..))))...))..))))))))))........ |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..((.(((((((....)))))))........((((.....(((((............)))))..))))....)).))))))))))........ |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((.....))))...(((((((...[[[[))))))).......((((..]]]]......))))......(((((.........)))))....... |