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GGCGGGCCUCCCCGCAUUGUGAGGUAGUGAAUCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCUAUUUUUCGCAAGUGCCGGGGGUUCGGCUCGCCACCCGUAUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
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Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((.(((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))).))))).)))))...((....)).))))..)) |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))))).))).)))))...))))))))......... |
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Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((.................(((....)))................)))))))).)))))))))....)))))))......... |
|
CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).)))))....)))))............ |
|
CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))))).))).)))))...))))))))......... |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((.((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))))...))))))...))))))))......... |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((..((((((((.......(((((......)))))....(((.......)))...))))))))....))))))...))))))))......... |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))).)))).))))))...))))))))......... |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))).)))).))))))...))))))))......... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).))).)))))...))))))))......... |
|
MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).)))).))))...))))))))......... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((..(......((..((....(((......((((....(((....)))....))))...)))......))...))..........)..)))........... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)))).)))))...))))))))......... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((..((((((((..(((..(((((......)))))..........))).......))))))))....))))))...))))))))......... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((((...(((((.............................................)))))....).)))))..................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).))))...................... |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).))))...................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................(.....)((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........................(.....)(((.....(((....))).....))).............................................. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))))).))).)))))...))))))))......... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((((((((((((....((((....(((....)))....))))).)))))..)))))).)))).)))))...))))))))......... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((..((((((((...(((((......)))))..............)))))))).....))))).)))))...))))))))......... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....)))).............................................. |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))......................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))).)))).))))))...))))))))......... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))).)))).))))))...))))))))......... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))))).))).)))))...))))))))......... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((...(((((((((((((((((((.....((((((..((((..))))..))))))..))))..)))))))).)).)))))....(((..))).)))))... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((((..((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))))....)))))....))))))))......... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((.((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)))..)))))...))))))))......... |
|
TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).)))))...))))))))......... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))))).))).)))))...))))))))......... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))).)))).))))))...))))))))......... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((....))))).......((((.....(((((......))))).(((((.............))))).....))))..((((..((....))))))..... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((..........))))).((((.(((((......)))))..(((.............))).))))...))))..((((..((....))))))..... |
