RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00239

RNA: SRP_00239
Rfam family: Plant_SRP

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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((.[[[[[))).((((....(((....)))........)))).]]]]]........(((((((..(((((((((((((.....((((((((..(((.((((((((((((((........)))....(((((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))))......))))))).))))((((((....)))))))))))))))))....))))...((((....)))))))))..))))...)))))))((((((.....[[[[)))))).............]]]]...........
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((........))))..((..(((.....)))..)).((((((((.((.....(((((.((((((....(((.(((((((.((......))......(((((((((((((((........)))....(((((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))))......))))))).))))).(((((.((((.((....((((((....(((....((((((....)))))).....)))..))))))....)))))).))))).))))))).)))..)))))).)))))))))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((........))))......(((....))))))...((((((((.((....(((.......((((((......((((((..................((((((((((((((........)))....(((((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))))......))))))).))))..(((((.((((.......(((((.....(((....((((((....)))))).....)))...)))))......)))).))))).)))))))))))).......)))...))))))))))
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((........))))......(((....)))......((((((((.((.....(((((.((((((....(((.(((((((.((......))......(((((((((((((((........)))....(((((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))))......))))))).))))).(((((.((((.((....((((((....(((....((((((....)))))).....)))..))))))....)))))).))))).))))))).)))..)))))).)))))))))))))))
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((........))))......(((....)))......((((((((.((.....(((((.((((((....(((.(((((((....(((.....)))..(((((((((((((((........)))...((((((((((((((...((((((....))))))..))))))))))))).)....))))))).))))).(((((.((((.((.((.((((((....(((....((((((....)))))).....)))..))))))..)))))))).))))).))))))).)))..)))))).)))))))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((.....(((((.......)))))..((((...)))))))))....)))))))((((..((((....(((((.....((((((((..........(((((((..................(((((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))))......))))))).....((((((....))))))...))))))))....))))).........(((((.((((................(((((((.......))))))).)))).)))))..)))))))).......
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................(((....)))............................................((((((.......(((.........(((((((.((.(((((.((((.((((..((((((..((((((((((....))).....)))))))..)))))).......(((((......(((....(((......)))....)))....)))))..))))))))..)))))))....)))))))...)))...)))))).........................................
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((........))))).....(((....))))))...((((((((.((.(..(((((((.(.((((((((.....((((((.............(((.((((((((((((((........)))....(((((((((..((...((((((....))))))..))..)))))))))......))))))).))))((((((....)))))))))((((((....(((....((((((....)))))).....)))..)))))).....))))))((.....)).))))))))).))).))))..)))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(..)((((........)))).((.(((((....)))))))..(((((.((................(((..((((.(.(((((((.(.((.(((((.(..(((...((((((.......))))))((...))(((((((((((((.(((((((((..))))))))))))))))))))))..)))..))).)))))((...))((((.((......)))))).(...(((((.((((((......))))))).).)))....)....((..))........).)))))))(........)..)))))))))).)))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...................................((..............))..........(((((((.....((...(..(..(....(((............(((((((.((.((((..(.((.(.....((((((.(((((.(.(((....)))...)....)))))).))))).......((.((......(((...(((..........))).)))....)).))....).)).)...))))))....)))))))........)))...........)..)...)....)).........))).))))...
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((........))))......(((....))))))...((((((((.((.(..((......((((.....((..(((((((..................((((((((((((((........)))....(((((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))))......))))))).))))..(((((.(((........((((((....(((....((((((....)))))).....)))..)))))).......))).))))).)))))))..))...))))..))..)))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..((((........))))......(((....))))))...((((((((.((.....(((((.((((((....((..(((((((.................(((((((((((((((........)))....(((((((((..((...((((((....))))))..))..)))))))))......))))))).))))).(((((.((((.((.((.((((((....(((....((((((....)))))).....)))..))))))..)))))))).))))).)))))))..))..)))))).)))))))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((........))))((((.......))))..(((((..((....))..)).))).(((...((((....)))).((((.....(((((.........)).)))..))))...))).((((......(((((((((((((...((((((....))))))..)))))))))))))....((((.((((.((((.....))))))))......((((......)))))))).((((....)))).((((...(((.........)))(((((.......)))))...)))).....))))..............
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