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AACCGGGGACCUCAUGGAAUAAAUUAGUUCGAACCAGGUCAGGACAGGAAUGUAGCAGCCUUAAGAAUCAUACUUAUGCCUUGAGAUAAUCUCCGGUUUUUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((.((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))).)).))))....)))))))....)) |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((.((..(((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))..)).))))....))))))))).... |
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Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........................................................((((((..............))))))................. |
|
CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
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|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.................((((...........))))..............((((((..............))))))....))))))))).... |
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DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................((((....(((....)))....))))......................................... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((.((((....((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....))))....))))....))))))))).... |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
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(((((((((.((((.((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))).)).))))....))))))))).... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((...(....(((.(((((.....((((....(((....)))....))))...))).))....))).)...))))...))))))))).... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................((((....(((....)))....))))......................................... |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................................................................................... |
|
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
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...................................((((....(((....)))....))))......................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((..............((((...........)))))))...........((((((..............))))))....))))))))).... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................((((....(((....)))....))))......................................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................((((....(((....)))....))))......................................... |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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|
PETfold_2.0(20)
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...................................((((....(((....)))....))))......................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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..........(((((..(((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))..)))))).)).))))................. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PPfold(20)
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[ FASTA input ] |
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...................................(((.....(((....))).....)))......................................... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((.((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))).)).))))....))))))))).... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((....((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....))))....))))....))))))))).... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((....((((....((((.....((((..................))))...)))).....))))....))))....))))))))).... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................((((....(((....)))....))))......................................... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................((((....(((....)))....))))......................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((.((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))).)).))))....))))))))).... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((.((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))).)).))))....))))))))).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((.((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))).)).))))....))))))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.(((.((((((..........))))))((((((..((....))..))))))(....).(((...........))))).).))))))))).... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.......................(..(...(......((.....(.......(.....(.(....).)..)...)....))......)....).)..)). |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..............................................................((......(.........(....).........)...)). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((.((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))).)).))))....))))))))).... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((.((((.((..(((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))..)).))))....))))))))..... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((.((((.((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)))).)).))))....))))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....(((((((......)))).....((((..................)))).......))).((((.....))))....))))))))..... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....(((((((......)))).....((((..................)))).......))).((((.....))))....))))))))..... |
