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GGAAACCUUCUCGGUUCCUCGCAAUGGUGUCUGGUUUACCCGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCAAAGUCAGAAUUUCUGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAAGGUUUCCACCCAACG |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((((((..((((((((....(((....(((....)))....))).))))))))....)))).))).)))....))))))))))))))))........ |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................(((....)))............................................................ |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.(........(((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)).))))............)))))........... |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((.((((..((((..((((........(((....(((....)))....))).....))))....))))....))))....))))))))))))))))........ |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((.(((...(((.(((..((((......))))...))).))))))....((((...))))..)).))))....))))))))))))))))........ |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.......((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))).))).)))))..).)))))...........)).... |
|
MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................((((....(((....)))....)))).................................................... |
|
Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................((((....(((....)))....)))).................................................... |
|
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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|
McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((........((((((((..((((......)))).............))))))))............))))....))))))))))))))))........ |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................((((((....(((((................................))))).....))))))................. |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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..................(((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)).)))............................. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................((((....(((....)))....)))).................................................... |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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........................................(((.....(((....))).....))).................................................... |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((((((..((((..((....(((....(((....)))....))).))..))))....)))).))).)))....))))))))))))))))........ |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((.(((...(((.(((..((((......))))...))).))))))....((((...))))..)).))))....))))))))))))))))........ |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((...((((...........((((......)))).........))))....((((...)))).....))))....))))))))))))))))........ |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........((((.................................(((....))).....................................))))................... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))............................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................((((....(((....)))....)))).................................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((((((..((((..((....(((....(((....)))....))).))..))))....)))).)).))))....))))))))))))))))........ |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((.(((...(((.(((..((((......))))...))).))))))....(((.....)))..)).))))....))))))))))))))))........ |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((((((..((((..((....(((....(((....)))....))).))..))))....)))).))).)))....))))))))))))))))........ |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((..((......))((((........).)))..((..)).))(((((..(((.......))))))))...(((..)))))))))))))))))))........ |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((..............................((........(....(.((.........(.((.......(...)....)))......)).)....)..........))..)).... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................................................................(....(.(.....(......).....).)...). |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((.......(((...............(((....)))............)))..........))).)))....))))))))))))))))........ |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.((((((((((..(((((.......(((....(((....)))....)))....)))))....)))).)).))))....))))))))))))))))........ |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((.(((((((..(..((((..((....(((....(((....)))....))).))..))))....)..).)).))))....))))))))))))))))........ |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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