|
|
|
GAUCCGUAACGCGAGCUUAUAACUCGAGCGGGGGCUAUAAAGGUGGUGUGGAACGAGCUGACUCGACCUGCCGGGUUGGGCCAGGGACUGCGGUGCUGGCUCGCCCGUUCCAAGUCGGGUAGUGGGCCAUGUGGCUUGGGCGAAGGCCUGGGUUUCUUGGCC |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
((.(..........).))....((((..))))............................................................................................(((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((..((.((((.......)))).(((((.(((((....)))))......((((....)))).)))))(((((.(((((((...........))))))))))))......)))))))....(((((...(((((((((....)))))))))...))))) |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((.....((((.......))))..))).........................(((.(((((((.((.(((((.(((((((..((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(.(((((((((....))))))))).).))))) |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.((........)).)......(((....)))............................................................................................(((((.(.(((((((((....))))))))).).))))) |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((......((((.......))))....))).).....((.(.((.....)).).)).(((((((.((.(((((.(((((((...........))))))))))))...)).)))))))....(((((.(.(((((((((....))))))))).).))))) |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((....((((.......)))).)))))..((........))..........(((.(((((((.((.(((((.(((((((..(((()))).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(.(((((((((....))))))))).).))))) |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((...((((.......)))).[[[[[.(((.....)))..)))))).((((....)))).]]]]](((((.(((((((.[[[[......)))))))))))).....]]]]........(((((...((((..(((....)))..))))...))))) |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).((((.((((((.((.(((((.((((((.(.((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((...(((((((((....)))))))))...))))) |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((...((((.(.((((((.(((......))).))).))).).))))))).)..((((.((((((.((.(((((.(((((((.(.......).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(..(((..(((....)))..)))..).))))) |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((.....((((.......))))..))).........................(((.(((((((.((.(((((.(((((((..((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((...(((((((((....)))))))))...))))) |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).(((.(((((((.((.(((((.(((((((..((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((...(((((((((....)))))))))...))))) |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.....((((.......)))).(((((((((............[[[[[[[)))).......))))))))))).(((((((((.........((((((((.]]]]]]].........))))))))....((((((((....))))))))))))))))) |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).(((.(((((((.((.((((.((((((((..((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((...((((..(((....)))..))))...))))) |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).(((.(((((((....(((((.(((((((...........))))))))))))......)))))))))).(((((...(((((((((....)))))))))...))))) |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((....((((.......)))).))))).(((((....))))).............(((((((....((((.((((((((...........))))))))))))......)))))))....(((((...(((((((((....)))))))))...))))) |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((.(.((((((.(((......))).))).))).).))))...))).((((.((((((.((.(((((.(((((((.(.(....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(..(((..(((....)))..)))..).))))) |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).....(((((((.((.(((((.(((((((..((....)).))))))))))))...)).))))))).)).(((((...((((..(((....)))..))))...))))) |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((....((((.......)))).))))).(((((.....(((..(((((((.((.((((((......))))))(((((((.(.(....)).))))))))).)))))))..))).))))).(((((.(..(((..(((....)))..)))..).))))) |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(.((((..(.((((.((..))))))))))).)((((..........((((((((.((((.((((((((...)))))))).)))).(((........))).....))))))))(...).)))).(((((((((((((((((...).)))))))))))))))) |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((...((((.(.(.((((.(((......))).))))..).).)))))))....((((.((((((.((.((((.((((((((.(.......).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(..(((..(((....)))..)))..).))))) |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).(((.(((((((.((.(((((.((((((.(.((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((....(((..(((....)))..)))....))))) |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((......((((.......)))).(((((.(((((....)))))......((((....)))).))))).)))...((((((...........)))))).(((((........)))))...(((((....))))).(((....)))...(((....))). |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((...((((.......)))).[[[...(((((....))))).[[(((((((....)))){{{)))..}}}[[[[[[[[....)))))..]]]]]]]]((((]]]]]...)))).....((((....)))).((((....)))).((((....)))) |