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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00245



RNA: SRP_00245
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((..((.((((.......)))).(((((.(((((....)))))......((((....)))).)))))(((((.(((((((...........))))))))))))......)))))))....(((((...(((((((((....)))))))))...)))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((.....((((.......))))..))).........................(((.(((((((.((.(((((.(((((((..((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (.((........)).)......(((....)))............................................................................................(((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (.(((......((((.......))))....))).).....((.(.((.....)).).)).(((((((.((.(((((.(((((((...........))))))))))))...)).)))))))....(((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((....((((.......)))).)))))..((........))..........(((.(((((((.((.(((((.(((((((..(((()))).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(.(((((((((....))))))))).).)))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((...((((.......)))).[[[[[.(((.....)))..)))))).((((....)))).]]]]](((((.(((((((.[[[[......)))))))))))).....]]]]........(((((...((((..(((....)))..))))...)))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).((((.((((((.((.(((((.((((((.(.((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((...(((((((((....)))))))))...)))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (.(((...((((.(.((((((.(((......))).))).))).).))))))).)..((((.((((((.((.(((((.(((((((.(.......).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(..(((..(((....)))..)))..).)))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((.....((((.......))))..))).........................(((.(((((((.((.(((((.(((((((..((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((...(((((((((....)))))))))...)))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).(((.(((((((.((.(((((.(((((((..((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((...(((((((((....)))))))))...)))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.....((((.......)))).(((((((((............[[[[[[[)))).......))))))))))).(((((((((.........((((((((.]]]]]]].........))))))))....((((((((....)))))))))))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).(((.(((((((.((.((((.((((((((..((....)).))))))))))))...)).)))))))))).(((((...((((..(((....)))..))))...)))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((..((((.(((((((.(((......))).))))..)))..))))..))).(((.(((((((....(((((.(((((((...........))))))))))))......)))))))))).(((((...(((((((((....)))))))))...)))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((....((((.......)))).))))).(((((....))))).............(((((((....((((.((((((((...........))))))))))))......)))))))....(((((...(((((((((....)))))))))...)))))
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((...((((.(.(.((((.(((......))).))))..).).)))))))....((((.((((((.((.((((.((((((((.(.......).))))))))))))...)).)))))))))).(((((.(..(((..(((....)))..)))..).)))))
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((...((((.......)))).[[[...(((((....))))).[[(((((((....)))){{{)))..}}}[[[[[[[[....)))))..]]]]]]]]((((]]]]]...)))).....((((....)))).((((....)))).((((....))))