RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00247

RNA: SRP_00247
Rfam family: Metazoa_SRP

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((........))))))(((.(((((....))))))))(((((.(((....((((((((((((((......((((((((...((.(((((.....((((((((...((((..(((((((((((((..((((((((((((....)))))).))))))..)))).....((((.((....)).(((....(((....)))....))).....)))).)))))))))...)))).....))))))))..))))).))..))))))))))))).))))..)))))...))).))))).........
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DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((..........)))).....(((........))).....((((.(.....((((((.(((((((......(((((((((.(((..((((......(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((....)))))).).))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).)..)))))))...)))))))...))).).)))))))))))))))).))).)..)))))....).))))...........
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(((((((((...((....))...)).)))))))...))).((((.(((....(((((((((((.((.(((....((((((..(((.(((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.(((((((((((((....)))))).))))))).)))((((...(((..((...((......))...))..)))...))))..........)))))))))..)))))))...))))))))..))))).))).))))))))))).)))))..))))))...))).))))..........
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((([[......))))))(((.(((((]]..))))))))(((((.(((....((((((((((((((......((((((((..(((.(((((.....((((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((((((((....)))))).))))))).))))........(((..((....(((....(((....)))....)))....)).))))))))))))..)))))))...))))))))..))))).))).)))))))))))).))))..))))))...))).))))).........
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.....((((.......((((((((((....)))))...))))).....(((((((.....(((((......((((((((......(((((.....((((((((((((.((((...((((.(((((.(((((((((((((....)))))).))))))).))))).........))))..))))(((((((((...................))))).))))..))))..........))))))))..))))).....)))))))))))))))))))).)))).....))))............
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................(((........))).....((((.......(((((....(((((.....(....).....................((((((((.(((((...((((((((((..(((((..((((((....))))))...)))))..)))......(.(((((......(((....(((....)))....)))....)))))))))))))....)))))))...))))))......................)))).)......)))))......))))...........
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((...)).)))))).((((.((((.........))))....)))))).(((((((((((.((.(((....((((((..(((.(((((.....((((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((((((((....)))))).))))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...))))))))..))))).))).))))))))))).)))))..)))))).....................
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((.(((((..((((((((((((....((((..))))....((..)))))))))..((......))(((((((((((((((((..........).))).........(((((((...((......))...((((..)))))))))))..)))))))))))))...)))))((((((.(((((((.((.((((......)))(((((...(((.((..)))))..))))).....((.(((((......))))).))..))))))))))).)))))))))))))).))))..((((..))))
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(((((((.....((....))......)))))))...)))(((((.(((.(..(((((((((((.((.((....(((((((..(((.(((((.....((((((((((.(((((.((((((((.((((.(((((((((((((....)))))).))))))).))))...................(((....(((....)))....)))...........))))))))..)))))))...))))))))..))))).))).))))))))))).)))))..))))))..)))).))))).........
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((bbbbbb...)))..BBBBBB(((....)))...(((.....)))..(((..((((((((....<<<<.))))).>>>>..(((((.(((.....))).((((((....)).))))....((((......(((((((((((((....)))))).)))))))...))))...)))))....((((((((..[[[[.[[.))))....((((...]]]]]].))))....{{{))))...((((}}}.....))))((((.((....)))))).aaaa.))).....AAAA..........)))....

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