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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00251



RNA: SRP_00251
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((.(((.((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...))))).)..)))))))))).)))..........
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).))))).).)))..)))))))))........).)
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .............(((.((((...((((...((((......(((.....(((....))).....)))...))))....)))).....))))...)))......................
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).))).))))...)))))))))))))))).........
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .................................................(((....)))............................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)).)))))...)))))....................
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...............................((((......(((((((((((....)))))))))))...)))).............................................
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).))))).).)))))))))))))))).........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((((((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).))))).).)))))))))................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...)))))...)))))))))))))))).........
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((((.((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).).)))).)).))))).).)))))))))))))))).........
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((.........[[[[[(.............{{{{{..)))))....(((()]]]]]....))))..}}}}}....)))))))))))))))).........
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((...(((.....((...((((......((((....(((....)))....))))...))))....)).......))).....)))))...................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((.(((((..((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))))....)))))...)))..))))))))))).........
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).........
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).))))).).)))..))))))))))).........
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).........
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((((.((((((..)))).)))))))).)))))))).)))).))).)))).).)))))))))))))))).........
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((........((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)))))).)).)))))..))))))).............))....
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ........((((((((((((((((((((...(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))).)).))))).).)))))))).................
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................................................................................................
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((..((((((((.((((((...(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))).))..)))).).)))..))).................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).........
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((..((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).....))))..)))))...)))))))))))))))).........
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ............((((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).)))))...)))).....................
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................((((....(((....)))....))))....................................................
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..................((((((((((((.(((((.....((((..(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).)))).............................
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................((((....(((....)))....))))....................................................
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..................((((((((((((.(((((.....((((..(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).)))).............................
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................((((....(((....)))....))))....................................................
PPfold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................(((.....(((....))).....)))....................................................
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).))).))))...)))..))))))))))).........
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.((((((((((((.(((((([...((((.....(((....))).....)))]))))))))..)))).)).)))))...)))))))))))))))).........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((..((((..((((((....((((......))))...............)))))).....))))..)))))...)))))))))))))))).........
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........((((..................................(((....)))....................................))))....................
RNAalifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .................................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))...............................................
RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................((((....(((....)))....))))....................................................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).))))).).)))..))))))))))).........
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).........
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).))).)))).).)))..))))))))))).........
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.((((((((..(..((.(.((((((..))))).)).))))).))))))..)))).)).))))).).)))))))))))))))).........
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.................................(......(..((..(.((...(..........(..................).....)..)).)...))..).......))....
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((((((.(((((..((((...((((......(((.....(((....))).....)))...))))....))))....)))))...)))))))..................
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).))))).).)))..))))))))))).........
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).)))))...)))))))))))))))).........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).)).)))))...)))..))))))))))).........
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((......))))....((((.........))))...((((......))))..((((((..(((((..........)))..(((((.......))))).)).))))))........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((......)))).(((((((......[[[)))....((((......))))..)))).....(((.((.]]]...))))).((((.....)))).((((((........)))))).