RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00253

RNA: SRP_00253
Rfam family: Metazoa_SRP

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.((((((((......))))))))...((((((......))))))....((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((..(((......)))))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....))))))))))...))))))))...........)
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))(((.((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((((((((.(((.(((.((.(((((..(((......)))))).)).))))))))......(((((...)))))....)))))).(((((((((((.....)))).)))))..))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....))))))))))...)))))))).....)))....
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))....((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((.((...((((((.....((((((((((.(((((.((((((((((((((.((...)).))))).....((((.......)))).........((((.............(((.....)))...........))))..)))))))))..))))))))...)))))))..))))))))))).))))))))))).....))))))))))...))))))))............
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......)))))).....(((((((...((((((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((.(.((....)).).))).)))).)))..........((.......(((....(((.....)))....))).....))...)))))))))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....))))))))))...))))))).............
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))(((.((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((..(((......)))))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....))))))))))...)))))))).....)))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......)))))))).(.((((((......)))))))...((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((.(((...(((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((..(((......)))))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))))))).))))))))))).....))))))))))...))))))))............
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))(((.((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((..(((([[[[[[.....[[[[[[[[[[.[[[[[.[[[[[[[[.(((((.........))))).............[[[[[...........(((((...)))))....(((.....)))....)))).....]]]]]]]]]]]]]..]]]]]]]]...]]]]]]]..]]]]]]..))).))))))))))).....))))))))))...)))))))).....)))....
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PPfold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.((((.(......).)))).....(((....(...)...))))))....(((((.((....(((((...(((((((((.(((((.((.....((((......(((((((((.(((((.((((((((.((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).....(.(((((......(((...((((.....)))..).)))....)))))).))))))))..))))))))...))))))...))))..))))))).)))))))))......)))))................)).)))))...
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))....((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((..(((......)))))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....))))))))))...))))))))............
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))....((((((((...((((((((((..(((((((((((..........((((((.....(((((((...((((..((((((....(((((.........))))).....((((.......)))).........(((((...)))))....))))))...(((((((((.....)))).)))))...........))))..)))))))..))))))......))))))))))).....))))))))))...))))))))............
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................(((............)))...................(((((....((((((((((.....((.....((((......(((((((((.(((((...((((((((((..(((((..((((((....))))))..)))))..))).....(.(((((......(((....(((.....)))....)))....)))))))))))))....)))))))...)))))))...))))..))....)))))))))).......)))))...........................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))....((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((.(.((....)).).))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....))))))))))...))))))))............
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.((((((......)))))).....((((((......)))))))).(((((((((...((((((((((..(((((((((((.(((.(((...(((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((..(((......)))))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))))))).))))))))))).....))))))))))...)))))))........))...
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((((..)..))))))))..(((((......)))))..((((.((((((((((((((((((((((...((.((((.(.(((.((((...))))))).(((((((((((.(((((..(((((((((((((.........))))).((((.((((.(....(((((((((..)).)))).)))...)))))))))....(...).(((((...))))).))))))))...))))))))........((((..))))).))))))).)))))))..).).))))))))))))))))))))...)).))....
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))....((((((((...(..(((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((.(.((....)).).))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....)))))))..)...))))))))............
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((((......))))).....(((((......)))))))))...((((((((...(..(((((((..(((((((((((.(((......((((((.....((((((((((.(((((.(((((((((.(((.((((.(((..(((......)))))).)))).)))........(((((......(((....(((.....)))....)))....))))).)))))))))..))))))))...)))))))..))))))..))).))))))))))).....)))))))..)...))))))))............
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((((......))))))))...((((((......))))))........((((.(((....(((((((........))))))).(((.....))).(((((.....))))).))).(((((.....(((((.........))))).....((((.......)))).........((((.....)))).....)))))....((((((((.....)))).)))).(((((.((((.....)))))))))......(((.(((.......))).((((.....)))).....)))..........))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((...((((((...aaa))))))....(((((...[[[[.))).....))AAA..]]]].(((((((....{{{{)))))))((((.....)))).((((.....)))).((((((.........<<<<<))))))...>>>>>.((((((((.......))))......((.((((..bbb))))......BBB.....((((((((.....)))).)))).(((((.((((.....)))))))))....)).((((((.}}}}..))).((((.....))))....))).)))).......))))...

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