RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00254

RNA: SRP_00254
Rfam family: Fungi_SRP

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........(((((...((((((...((((.....)))).((((((((((.....(((.......((((((........(((((...((((((((((...((((.((....))))))..))).)))).((.(((.(((((...((..(((((.........)))))....))..))))).)))))...)))...))))).))))))........)))....)))))))))).......))))))..))).))....
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((.......)))...........((((((.......((((((((((.((..(((.......((((((...................(((((....(((((.((....)))))))....))))).....((.(((((.......(((((.........)))))........))))).))..................))))))........))).)).))))))))))...))))))................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...........))))..(((.......))).((((((((((.((..(((......(((((((((.((((.((.((((((..(((((..(.(((((.((....))))))).)..)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).)))...))))).)......))).)).))))))))))................)))).....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....))))))(((.....((((((((.(....((((((((((.(((.(((..(...(((((((((.((((.((.((((.((.((((((.(.(((((.((....))))))).)).))))).)).)((.(((((..(((..(((((.........)))))....))).))))).))))).))..)))).))...)))))).).)....)))))).)))))))))).))))))))).....))).......
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((.......))...........((((((................((...........((.(((((.((((((((.(((((((((....((((((((((((.((....))))))))))))))...........((((......((((....(((....)))....))))..)))).)))))))))..))))))))....)))).)))...........))............))))))...............
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((......((((((....(((..((((.....)))).((((((((((.....(((...........((((.((((....((((((..(((((....(((((.........)))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).....)))).))))...............)))....)))))))))).)))..))))))....)))).....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....))))).(((.((..((((((((......((((((((((.(((.(((.......((((((((.((((.((.((((((..(((((....(((((.((....)))))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).))))...))))........)))))).))))))))))..))))))))...))))).......
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.......)))))(((.....(((((((.((....((((((((((.(((.(((.......((((((((.((((....((((((..(((((....(((((.((....)))))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).....)))).)))...)))))........)))))).)))))))))).))))))))).....))).......
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....))))).(((.((..((((((((......((((((((((.(((.(((.......((((((((.((((.((.((((((..((((.....(((((.((....))))))).....))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).)))...)))))........)))))).))))))))))..))))))))...))))).......
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..........[[[.....[[[[[[[[......[[[[[[[[[[.........[[[[[.[[[[[[........[[[[[..........[[[[[[..................[[[[.............[[[[[.......................)))))).....]]]]]...]]]]]]]]]]..]]]]].]]]]]]..........]]]]]]]]]]]]]]]..]]]]]]]].....]]].......
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....))))).(((.((..(((((((.((....((((((((((.(((.(((.......((((((((.((((.((.((((((..(((((....(((((.((....)))))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).))))...))))........)))))).)))))))))).)))))))))...))))).......
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...)))))))(((.((..((((((((.(....((((((((((.(((.((((....((((((((((.((((....((((((..(((((((..(((((.((....))))))).)).)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).....)))).)))...))))).).)..).)))))).)))))))))).)))))))))...))))).......
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...........))))..((((((((......((((((((((....((((((....))))))..((((...(((((.......((((......)))).........(((((((.((((.......))))..((((...))))...............)))))))....((((........))))..))))).)))).................))))))))))..))))))))......)))).....
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RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....))))).(((.((..(((((((.((....((((((((((.(((.(((.......((((((((.((((.((.((((((..(((((....(((((.((....)))))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).))))...))))........)))))).)))))))))).)))))))).)..))))).......
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((...)))))).(((.((..((((.....)))).((((((((((.(((.(((.......((((((((.((((.((.((((((..(((((....(((((.((....)))))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).))...))))))........)))))).)))))))))).............))))).......
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....))))))(((.((..(((((((.((....((((((((((.(((.(((.......((((((((.((((.((.((((((..(((((....(((((.((....)))))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).))))...))))........)))))).)))))))))).)))))))).)..))))).......
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...((((..)).)).((((((((((((..........)))))...((((......).)))..((((...).)))(........)((..(((.....)))..))((..))))).))))..)))).((((((((.((((((((((.........)))))..(........).((((((((((((..........).))).))))..))))((.((......)).)))))))))))).))))))).....
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................................................................................(..............................................((......)).....................................................................................)...
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....))))).(((.((...((((((.......((((((((((.(((.(((.......((((.(((.((((.((.((((((..(((((....(((((.((....)))))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).)))....))))........)))))).))))))))))...))))))....))))).......
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....))))).(((.((..((((((((......((((((((((.(((.(((.......((((((((.((((.((.((((((..(((((....(((((.((....)))))))....)))))........(((((......((((....(((....)))....))))..))))))))))).))..)))).))))...))))........)))))).))))))))))..))))))))...))))).......
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((....(((...((((...((((.......))))......(((((((((........))))).))))...((((.....))))....))))..((((.((....)))))).))).((((.......)))).)))))))....(((.........))).((((............)))).(((...((((((.........))))))..((((..........((((......)))).)))).)))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....))))).........((((.{{{{))))........}}}}...((((((....)))))).((((..((((.[[[.))))....(((..(((((.((....)))))))]]].((((.......)))).))).....((((..................))))..)))).((((...........)))).((((......))))..((((..........((((......)))).))))........

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