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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00263



RNA: SRP_00263
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((..(((((((((((....)))))))))))...))...((((((((.(((((....))))).......((((..((((((..(((((((((........((((((...((((((((((((...(((((..((((((((((((..((((((...............))))))...)))).......(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).))))))))....))))).....))))..)))))))).))))))......)))))).)))..))).)))..)))))))))))).
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((((((((..)))))))))))))..................(((....)))((((((((.((((..((((((..((((((((((...(((.((((((...((((((((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((.((.........)).)))))))..))))..(((..((((....((..(((....((....)))))..))..)))).))))))))))).)..)))))))...))))..)))))))).))))))..)))))))))).)))..))).)))..)))).))))))))
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((....)))))))))))...........))))...(..........)(((((((.((((..((((((..((((((((((...(((.((((((...((((((((((((((.(((((..((((((((.(((.(((((((.((.(.....).)).)))))))..)))................((((.....((((....))..)).......))))..))))))))....))))))))...)))..)))))))).))))))..)))))))))).)))..))).)))..)))).))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((..))))))))))))...........))))..((((((..)))))).................((((((((((((((.......((((((...((((((((((((...(((((..((((((((((((((((((((...............)))))))..............((((.....(((...)))..........))))...))))))...)))))))....))))).....))))..)))))))).)))))).....))))))))...............))))))......
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((((((....))))))))))))............................((((((((.((((.(((((......((((((((.......((((((...((((((((((((...(((((..((((((((.....(((((((...............)))))))....................(((((....((((.............)))).))))).))))))))....))))).....))))..)))))))).)))))).....))))))))....))))).....)))).))))))))
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((.((((((((((....)))))))))).((..(((...)))..))(((((....)))))..))).(((((..((((((..((((((((((...(((.((((((...((((((((((((((.(((((..((((((((((((.(((((((.((.((....)))).)))))))..)))).((((...((((...((......))(((....))).)))).))))......))))))))....))))))))...)))..)))))))).))))))..)))))))))).)))..))).)))..))).)).......
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((....)))))))))))....(.....)))))..(((((....)))))((((((.((((..((((((..(((((((((...((((.((((((...(..(((((((((((.(((((..((((((((((((.(((((((.((.((....)))).)))))))..)))).((((...((((...((......))(((....))).)))).))))......))))))))....))))))))...)))..)))))..).))))))..)))))))))).)))..))).)))..)))).))))))..
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((((((((((((..))))))))))))((........)).).)).(((((..)))))((((((((((((..(((((((((((((((((...(((...(((((...((((((((((((((.(((((((.(((((.(((((((((((((.(((((...))))).)))))))).)))))..((..)).....(..((((((((((((..))))))))))))(...).)...)))))...))))))))))...)))..)))))))).)))))....))))))))).)))))))).)..)))))))))))))).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.(((((((((((....)))))))))))............)))...............(((((((.((((..((((((..(((((((((....(((.((((((...(..(((((((((((.(((((..((((((((.((..(((((((.((.........)).)))))))...)).....(((.((((...((......))(((....))).))))..)))......))))))))....)))))))...))))..)))))..).))))))..))).)))))).)))..))).)))..)))).))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((....)))))))))))...........))))..............(((((((..((((...(((((..(((((((((...((((.((((((...(..(((((((((((.(((((..((((((((((((.(((((((.((.((....)))).)))))))..))))....(((.((((...((......))(((....))).))))..)))......))))))))....))))))))...)))..)))))..).))))))..)))))))))).)))..))).))...))))..)))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((((....))))))))))).............(((.(((((....))))).....(((.((((...........(((.......))).(((.........)))))))((((......))))....((((((.((((((((((.......)).)).))))))..))))))..))).((((........................))))...((((....)))).)))..((((((...............(((((.....)))))...((((.....))))....))))))...........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((....))))))))))).................(((((....)))))..)))....((((..(((.....)))...((((.....{{{{{....))))..))))((((......))))....((((((.((((((((((.......)).)).))))))..))))))......((((.[[[[[......[[[[[.......))))..]]]]]..((((.]]]]].....))))......}}}}}...(((((..<<<)))))...((((.....)))).......>>>...........