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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00268



RNA: SRP_00268
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((..(((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...).))).)..))))))))))......
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((......((((((.((((.((.(((....(((....))).....))).)).))))......))))))))))))))))......
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((((..((......................(((....))).....((((......))))..))...))))))))).........
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((...((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).....)))..))))))))))))......
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((..........................(((....)))..........................))))))))))))......
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CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((.((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..))))).....))))..))))))))))).......
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((.....(((......(((.....(((....))).....)))...))).......)))..))))))))))))......
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...).)))..))))))))))))......
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((..(((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...).))).)..))))))))))......
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((...((((((....((((...(.(((....)))..)..))).))))))).....)))..))))))))))))......
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((.......((((........[[[.))))(((....)))......((((((.....))))))]]].)))))))))))......
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((.((.(..(((((......(((.....(((....))).....)))...)))))....).))..))))))))))).......
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((..[[[[.)))........]]]](((....)))..(((.[[[[[[)))..]]]]]]...))))))))))))......
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((...((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).....)))..))))))))))))......
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(.((.((((............))))(((....))).))...((((((.....)))))).).))))))))))))......
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((..[[..........(((.....(((....))).....))).............)))]]))))))))))))......
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..(((((((((.((..((((((.....((((....(((....)))....))))...))))))..).).)).))))))))..))......
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................................................................................
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((..((((............)))).....(((.((((........)))).)))..)))..))))))))))))......
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((..((((............)))).)))............((((((.....))))))...))))))))))))......
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((...((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).....)))..))))))))))))......
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((...................(((.....(((....))).....))).......((((....)))))))))))..........
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((....((((............))))(((....))).))...((((((.....))))))...))))))))))))......
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((......((((............))))................((((((.....))))))...))))))))))))......
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RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((.(......(((((.....(((.....(((....))).....)))..))))).........).))))))))..........
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((...((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).....)))..))))))))))))......
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(.((.((((............))))(((....))).))...((((((.....)))))).).))))))))))))......
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.....((.(((((.((...)).(.(.(.((.(((..))).).))))(((((((..)).))))))))))))))))))))......
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ........................(...(..((........(.....(.......)........)......))....)...)..........
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((..(((....(((((.....(((.(...(((....))).)...)))..)))))......)))...)))))))..........
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(........................(((....)))........................).))))))))))))......
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((...((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).....)))..))))))))))))......
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((.(((...(..(((.....(((.....(((....))).....)))..)))..).....)))..))))))))))))......
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((......((((............))))................((((((.....))))))...))))))))))))......
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((.....)))..((((......[[[[[[))))(((..{{{............)))(((}}}..))).......]]]]]].......