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GGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCCAUUU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(20)
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CentroidAlifold(seed)
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
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CentroidHomfold‑LAST
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ContextFold
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Contrafold
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Cylofold
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DAFS(20)
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DotKnot
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Fold
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HotKnots
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|
IPknot
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MCFold
(ext)
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MXScarna(seed)
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MXScarna(20)
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Mastr(seed)
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Mastr(20)
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MaxExpect
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|
McQFold
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|
Multilign(20)
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|
Murlet(20)
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|
NanoFolder
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PETfold_2.0(seed)
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PETfold_2.0(20)
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PETfold_pre2.0(seed)
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|
PETfold_pre2.0(20)
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|
PPfold(seed)
|
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..................................................................................................................... |
|
PPfold(20)
|
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((.(((((..(((((..(((((((...((((..................)))))))))))...)))))....)))))...))))))))))))))))....... |
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RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
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........((((((((.................................(((....)))...................................))))))))............... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.................................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))............................................. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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.........(((((((.(((((..(((((..((((......((((....(((....)))....))))...))))...)))))....)))))...)))))))................ |
|
RNAfold
|
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|
RNAshapes
|
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|
RNAsubopt
|
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|
RNAwolf
(ext)
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((((((((((((((((.(((..(((((((...((((....(((....)))....)))))))))))...)))..)))).)))).).))))))))))))))))....... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((((((.((((((((((((..(((((((...((((....(((....)))....)))))))))))...))))).))).))))...))))))))))))))))....... |
|
UNAFold
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[ FASTA input ] |
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|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((((((...(((((.(((((.....))))).((((......))))...............))))).(((((.........))))).)))))))))))))))....... |
|
Vsfold5
|
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