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GGUGACCCCAUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUUGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGGCACCACCUAUCU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.((((((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)).))))).).))))))))))).))........)) |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((.(((((((((.((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)).)).))).))))...)))).................... |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..(((((((((((.((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).))).))))...)))))))))))..)))........ |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................................................................................................................... |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
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.................................................(((....)))........................................................... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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ContextFold
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
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HotKnots
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
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((((.(((((((((((.((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).))).))))...))))))))))).))))........ |
|
MCFold
(ext)
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MXScarna(seed)
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|
MXScarna(20)
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Mastr(seed)
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...................................................................................................................... |
|
Mastr(20)
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|
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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|
McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
|
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Murlet(20)
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PETfold_2.0(seed)
|
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PETfold_2.0(20)
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PETfold_pre2.0(seed)
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PETfold_pre2.0(20)
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.........................................((((....(((....)))....))))................................................... |
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PPfold(seed)
|
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...................................................................................................................... |
|
PPfold(20)
|
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.........................................(((.....(((....))).....)))................................................... |
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PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
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((((.(((((((((((((((.((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).))).))))...))))))))))).))))........ |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((((((((.(((((((((((((.((((((....((((....(((....)))....))))).))))))..))))).))).))))...))))))))))).))))........ |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
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((((.(((((((((((.(((((..(((((..(((((....((((......))))...............)))))...)))))....)))))...))))))))))).))))........ |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........................................((((....(((....)))....))))................................................... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).............................................. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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...............................((((......((((....(((....)))....))))...))))............................................ |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAshapes
|
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RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAwolf
(ext)
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
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((((.((((((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).))).)))).).))))))))))).))))........ |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
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((((.(((((((((((.((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)).)))))...))))))))))).))))........ |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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((((.(((((((((((((((.((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).))).))))...))))))))))).))))........ |
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Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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