RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00282

RNA: SRP_00282
Rfam family: Metazoa_SRP

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((...((((((.....((((....)))))))))).)))).((((((.....(((((((((.(((((......((((((((((((((((..(((.......((((((....((((..((((((...(((((((((((((....)))))))))))))...(((((.....((((......)))).((((..................)))).))))).))))))))))..))))))......)))..))))).))))))))))).)))))))))))))).....))))))...
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ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((....))((((((.....((((....))))))))))......(((.(((....((((((((.((((((......((((((((((.((((((......(((.(((((((.(((...(((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).....))).)))...)))))))...))))))..)))))))))).))))))))))))))...))).)))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((........))))))(....)...............((((((.....(((((((((.(((((......(((((((((((((((((.((...((..(((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).))..))).))))).))...)))).)))))).))))))))))).)))))))))))))).....))))))...
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((..........))))...........((.......))...........((((((.((.(((((....(.((((.((((((((((((......(((.(((((((((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((....))))))).))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))..)..)))))))...)))))))...)))))).)))))).)))))))))))).))))))..............
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((...((((((.....((((....)))))))))).))))........(((.((((((....)))))).))).(((((((((((((((((...........((((((.(((...(((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).....))).))))))..........)))))).))))))))))).(((....[[[))).....]]].......
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((...((((((.....((((....)))))))))).)))).((((((.(((.((((((....)))))).))).(((((((((((((((((.((........((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).))..))).))))))........)))))))).))))))))))).(((((...)))))......))))))...
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((.[[[[[..)))))).........]]]]].......((((((.....(((((((((.(((((......(((((((((((((((((......(((.(((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).))..))).)))))...)))))...)))))).))))))))))).)))))))))))))).....))))))...
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((...((((((.....((((....)))))))))).)))).((((((.(((.((((((....)))))).))).(((((((((((((((((.((........((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).))..))).))))))........)))))))).))))))))))).((((.....))))......))))))...
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.(((...(((((((((((((......)))))).......)))))))..((((((....))))))..)))..........(((((...........))))).))))))..((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).))))....))))))))...(((((((..........(((((([[[[[....((((....))))....))))))........((((((....................)))))))))))))....]]]]]......
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((...((((((.....((((....)))))))))).)))).((((((((((.(((((([[[.)))))).))).(((((((((((((((((.(((...((.(((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).))..))).))))))...)))).)))))))).))))))))))).(((((]]])))))....).))))))...
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((........))))))...........((((((...........(((.((((((....)))))).))).(((((((((((((((((..((.......((((((.(((.(((((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).))..))).))))))......))..)))))).)))))))))))...)))))))).(((....))).......
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((.............((((..))))..)))))))....((((((((((.(((((((..))))))).))))(((((...((((.((.(((((..((((((((((...))))))))))..)))))..(((((((((((...).)))))))))).))))))....)))))((((((((.((((((((((....)))))))))))))))))).(((........)))(((......)))(((((((((.............))).)))))).(((......)))))))))...
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................((((....))))........(((......((((....))))......)))......(((((((((((((((((..(........((((((.(((.(((((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).))..))).)))))).......)..)))))).)))))))))))........(((.(....).))).......
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.((.(((....((..(((((....)))))..))..(((((....(((((....)))))....)))))..))).((((((((((((((((..((.......((((((.(((.(((((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).))))))).))..))).))))))......))..)))))).)))))))))).....)).)))..(((....))).......
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((....(((((.....((((....))))))))).((((......))))...((((((....))))))...........))).(((((...........)))))..(((.....((((..........)))).((((((....))))))....))).(((((....(((((((......)))...)))).....))))).((((....((((....))))....((((.....)))).((((.........))))......(((((......)))))....)))).......
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((bbbbbb..)))((((....))))BBBBBB.((((.....(((((....)))))ccccc))))....(((.....CCCCC..[[[[))).....(((((....]]]]..{{{{.....)))))}}}}.((((((....))))))..)))..((((..........<<<.)))).>>>.((((..........(((.((.....((((....))))....((((.....)))).((((......aaa))))....AAA..))..))).(((....)))))))......

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