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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00299



RNA: SRP_00299
Rfam family: Metazoa_SRP

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.....)))).....)))))).....((((((....((((((((((((.........)))))))).))))...(((..((((((((((((((((((..((((......))))...((((((((.....(((((.(((((...)))))...((((((......)))))).)))))(((..(((....))).((((((....(((((((((...)))).....)))))...))))))...))).))))))))))).)))))))))..))))))..)))))))))....
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(((((((......)))))))........))....(((...)))(((.((((..(((((((.(((((((....(((.(((((((((((.(((......(((((((((.(((((.((((.((((((((.(((((((.(((((....))))).))))))).))))........(((((......((((.(((......))).)..)))....))))).)))).))))..)))))))...)))))))...)))))))))))))).))))))))))..)))).)))..)))).)))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((.....)))).....))))))............((((.((((.....((((.(((((((........((((((((((((.........(((((((...(((((.((((.((((((((.(((((((.(((((....))))).))))))).)))).........((((......))))..(((((..................))))))))).))))..))))).....))))))).....))))))))))))....)))))))..))))......)))).))))...
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((..(((((..((((((((.(.(((((.((..(((((...)))))..)).))))).)....(((((((....(((.((((((((..(.(((......(((((((((.(((((.((((.((((((((.((((..(.(((((....))))).)..)))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))).))))..)))))))...)))))))...))))..)))))))).))))))))))))))))))...)))))..))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((..(((((..(..(((((.(.((((..((..(((((...)))))..))..)))).)....(((((((....(((.((((((((..(.(((......(((((((((.(((((.((((..((((((..((((..(.(((((....))))).)..))))..)))........(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))..))))..)))))))...)))))))...))))..)))))))).)))))))))))))))..)...)))))..))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((....))))..((((((.(((..((..((((.....))))..))..))).....(((.((((.....)))).((((((....)))))).....((((......(((......))).((((((.........)))))).((((.....)))).((((((((......)))).)))).))))..........))).))))))........((((.....))))...((((.....(((.......)))(((.....)))..))))...((((.((....)))))).......
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...aaaaa))))))....(((.<<<.((((..{{{))))..((((....))))))).((((.}}}.)))).((((((....))))))..(((((.((((.>>>AA......)))))))))...(((..[[[)))...((((.]]].)))).((((((((..ccc.)))).)))).CCC....(((((.................)))))bbb.bbbbb...)))......BBBBBBBB..(((.....)))..(((......)))((((.((....))))))AAA....