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| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(..((((((((((((((.(((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).))))....))))))))))..........)) |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..((((((((((.(((((((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).))))....))))))))))..)))....... |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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(((..((((((((((.(((((((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).))))....))))))))))..)))....... |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
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(((..((((((((((((((((((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).)))).)..))))))))))..)))....... |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
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DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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HotKnots
|
[ FASTA input ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((..((((((((((.(((((((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).))))....))))))))))..)))....... |
|
MCFold
(ext)
|
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|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.....((..((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)))))).))).))))..).))))))..))............ |
|
MXScarna(20)
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|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
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(((.........((((((((.((.(((...((((......((((....(((....)))....))))...))))....)))..))..)))).).)))..)))............... |
|
MaxExpect
|
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
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................................................(((....))).......................................................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
NanoFolder
|
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|
PETfold_2.0(seed)
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|
PETfold_2.0(20)
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
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.................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))........................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
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........................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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........................................(((.....(((....))).....))).................................................. |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
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(((..((((((((((((((.(((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).))))....))))))))))..)))....... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....((((((((((.(((((..((((...(((((....((((......))))...............)))))....))))....)))))....))))))))))............ |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.................................(((....)))....................................)))))................. |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))............................................. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................((((....(((....)))....)))).................................................. |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAshapes
|
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(((..((((((((((((((.(((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).))))....))))))))))..)))....... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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(................................(.(...(........................(...)......................)....).)........)........ |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
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|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
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(((..((((((((((.(((((((((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))).))).))))....))))))))))..)))....... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((....))))....(((((.......)))))...((((......))))...(((((...(((.........[[[[.))).]]]]......))))).(((.....))).... |
