RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00308

RNA: SRP_00308
Rfam family: Bacteria_large_SRP

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...(..(((((.......)))))..)..(((((....((((((.((((((........)))))))))))).(((..((..((((((....((((((..(((...(((...((((((((((((((((((((((((.....(((.((((....(((.(((.(....)))).)))..)))).))))))))).)).))))))...)))))))))))))..))).))))))..)).))))..)).))).))))).........))))))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(.((((((((..........................)))))).))..)......................................(....)...........................((.((((((((..((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....))))...)).))))))....))............................................................
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................................((((((((((((((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....)))))).)).))))))...)))))))).......................................................
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((((..[[[[[))))))...........]]]]]......(((.[[[[[))).....]]]]]...(((....)))(((((((.....((((((...))))))..)))))))(((((..(((..((((....))))......(((((...)))))....)))[[[[.....))))).......]]]](((((.(((((((((..............)))))))))..[[[....)))))..]]].........))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.......))))))....(((((...(((.....))).((((((((......))))).)))(((..((((((((....(((.((((..((((((.......(((((((((((((((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))...))))....)))))).)).))))))...)))))))))..))).))).)))))))....)))))))).))).))))).)))))...))))))
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................................................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................................................................................................................................
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NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(((((((((.cccccc))))))((((ffff({{{{{{{{{{{{{{.((((((((..dddd))).)))))))))((g(([[[[[[[[[[[[)G)aaaaa((eee)FFFFbbbbbbbbb(hhhh}}}}.}}hhh)))((((((()]((((((.CC))))))DDDD.<<<<<<}}}}}}}}..HHH))AAAAAiiii]]]]])HHHHBBBBB.CCCC((]]]]]])))BBB)))))))((.IIII)).>>>>>>BEEE.))))))
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................................((((((((((((((((((((((..((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...))))....)))))).)).))))))...)))))))).......................................................
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PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................((.............................................................................................................)).....(...((((.....((((....(((....)))....))))...)))).....)................................................................................
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................((...................................................................................................(((...))).)).....(...((((.....(((.....(((....))).....)))...)))).....)................................................................................
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((.......))))))..(.(((((...(((.....)))..(((((((......))))).))((((..((((((((((..((.(((((..((((((......((((((((((((((((((((((((..((([[[....(((....(((....)))....))).....))).]]])))))).)).))))))...)))))))))).))).))).))))))).)).)))))))).)))))))))))))))...))))))
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((......(((((.(...).))))).....(((((....((((((.....................))))))((((..((..(((((.....((((((..((((((.......(((((((((((((((((((((((.....(((.((((.....((.(((.(....)))).))...)))).))))))))).)).))))))...)))))))))..))).))).))))))...).))))..)).))))))))).........))))))
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