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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00324



RNA: SRP_00324
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] ((.((.(.((((..((((((.(((((((....((((....(((....)))....)))).))).))))))))))))...)).)..)).))...............
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((......(((((((((((((((.((((....((((....(((....)))....)))).)))).))))))))).)))))).(((.((....)))))......))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((...(((((((((((((((.((((....((((....(((....)))....)))).)))).))))))))).))))))...((((.......))))...)))
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((.(((((((((((((...(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).)))))))..........))..........
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((((((((((((((.((((...(((......(((....)))....)))..)))).)))))))))).))))).(((.........)))........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................(.((((....((((....(((....)))....)))).)))).).......................................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.((.(.(((((((((((((((.((((....((((....(((....)))....)))).)))).)))))))))).))))).)..)).))...............
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((....(((((((((((((((.((((...(((......(((....)))....)))..)))).)))))))))).))))).(((.((....)))))))......
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.......((((((((((((((....)))).[[[[(((....))).........[[[[[))))))))))]]]]]...]]]].......)))))......
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((..........(.((......((((....(((....)))....))))...)).)...........)).))............)))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((....(((((((((((((((.((((....((((....(((....)))....)))).)))).)))))))).))))))).(((.........)))))).....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((....(((((((((((((((.((((....((((....(((....)))....)))).)))).))))))))).)))))).(((.((....)))))))).....
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MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.......((((((((((((((((...(((.((((((((..))))).)))))))))))))))))))))))))))(((((.(((..))))))))......
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(((((((((((((((.((((..((.....((((....(((....)))....))))..))..)))).))))).))).........))...))))).))....
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((..(((((((((((((((.((((....(((([[[[(((....)))....)))).)))).)))))))))).)))))..]]]].....)))).........
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((((...(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))...)))))).)))))).......................
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((((((((((((((.((((....((((....(((....)))....)))).)))).))))))))).)))))).(((.((....)))))........
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Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((.....[[[[[[.((((((.((((....)))).......(((..((..........)).))))))))).[[[[)))..]]]]........]]]]]].....