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GACUCGGGCCAUGCGGCUCGGACGCCCAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGGAGCAGCCACACGGGAUGCUCAGAGCAGGCGUGGACUCCGGGUCACCCAACU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((.(((((((.....((((.....((....)).....))))...))).)).)).))))..))))))..))))))))........
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((...........((((((....))))))...(((((...........))))).))))..))))))..))))))))........ |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................................................................................... |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)))))))...))))).......... |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................(((((((((((....)))))))))))........................................... |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((......((...((((((....)))))).))(((((.((....).).))))).))))..))))))..))))))))........ |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((.((.((((.....((((.....((....)).....))))...)))...))).))))..))))))..))))))))........ |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((.((((.....(((.....((((.....((....)).....))))...))).......))))..))))))...)))))))........ |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((......((...((((((....)))))).))(((((.((....))..))))).))))..))))))..))))))))........ |
|
Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((....)))))))(((((....((((((....))))))...(((((......[[[[.)))))......))))).(((]]]].)))........ |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))........................................... |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((.((((...........((((((....))))))...(((((...........))))).))))..))))))...)))))))........ |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((((....))...((((((....))))))...(((((.((.....)).))))).))))..)))))).).)))))))........ |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((.((((..((((((((..))))))))))))(((((((...)))))))))))))))).))))).).)))))))........ |
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((.((((.((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...)))).)).)).)))...))))))))........ |
|
MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.(((((((..........((((....(((....)))....))))..........)))))))..))))))..))))))))........ |
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Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................................................................................... |
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Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
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................................((((....(((....)))....))))........................................... |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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.........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))).))))))................... |
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PETfold_2.0(20)
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................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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.........((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))).))))))................... |
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PETfold_pre2.0(20)
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................................((((....(((....)))....))))........................................... |
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PPfold(20)
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[ FASTA input ] |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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(((((((.((((((.((((...........((((((....))))))...(((((.((.....)).))))).))))..))))))...)))))))........ |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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((((((((((((((.((((...........((((((....))))))...(((((...........))))).))))..)))))).).)))))))........ |
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((...........((((((....))))))...(((((...........))))).))))..))))))..))))))))........ |
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RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((.................(((....................)))....................................))))........... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))..................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((...........((((((....))))))...(((((.((.....)).))))).))))..)))))).).)))))))........ |
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RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((...........((((((....))))))...(((((.((.....)).))))).))))..))))))..))))))))........ |
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RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((......((...((((((....)))))).))(((((.((.....)).))))).))))..)))))).).)))))))........ |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((.(.((.(((((..))))))))...(((((((..(((..)))..)))))))(((...)))))).)))(.((.(((((((..))))))))))... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(...................((.....(..((((.....(......).....))))..........).........))........)............ |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.((.(..((((((..(((.((..(((.....((((.....((....)).....))))...)))....)).)))...))))))...).))......).... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((.((((......((...((((((....)))))).))(((((.((.....)).))))).))))..)))))).).)))))))........ |
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UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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((((((((((((((.((((...........((((((....))))))...(((((.((.....)).))))).))))..)))))).).)))))))........ |
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Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....)))....(((((....((((((....))))))...((((..((.....))..))))......))))).....)))))))........ |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((....)))....(((((....((((((....))))))...((((..((.....))..))))......))))).....)))))))........ |
